距離分布と周波数に基づく逆相補ゲノム語の比較【JST・京大機械翻訳】

Tavares Ana Helena; Raymaekers Jakob; Rousseeuw Peter; Silva Raquel M.; Bastos Carlos A. C.; Pinho Armando; Brito Paula; Afreixo Vera

プレプリント

J-GLOBAL ID：202202216139561578 整理番号：21P0005212

距離分布と周波数に基づく逆相補ゲノム語の比較【JST・京大機械翻訳】

Comparing reverse complementary genomic words based on their distance distributions and frequencies

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発行年： 2017年10月06日プレプリントサーバーでの情報更新日： 2017年10月06日
JST資料番号： O7000B 資料種別：プレプリント
記事区分：プレプリント発行国：アメリカ合衆国 (USA) 言語：英語 (EN)

※このプレプリント論文は学術誌に掲載済みです。なお、学術誌掲載の際には一部内容が変更されている可能性があります。

本研究では,ヒトDNAにおける逆相補的ゲノム単語対を,その逆補体の距離分布と単語の頻度の両方を比較することによって研究した。距離分布間の非類似性のいくつかの測度を考察し,この設定においてピーク非類似性が最良であることを見出した。両分布が不規則で強いピークを含む場合でも,非常に類似した距離分布を持つ単語対と同様に,非常に異なる距離分布を有する逆相補的単語対の存在を報告する。分布非類似性と周波数不一致の間の関係も探索し,各測度の低い値と高値を組み合わせた対称対が関心の特徴を明らかにすると推測した。まとめると,著者らの結果は,ヒトゲノムにおけるいくつかの非対称性がChargaffの規則を越えていることを示唆する。本研究では,完全なヒトゲノムとその反復マスクバージョンの両方を用いた。【JST・京大機械翻訳】

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遺伝子の構造と化学 , 分子・遺伝情報処理

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