抄録/ポイント：
抄録/ポイント
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生物多様性研究は,大規模な遺伝的,分布的および形質データセットの連結を通して,生態学的および進化的仮説の期待の試験によって進歩した。過去30年間にわたる分子系統の上昇は,生物多様性研究を促進する地球周辺からのDNA配列データの豊富な結果をもたらした。しかし,分子系統学の進歩は,進化的関係の新しい推定と種限界の解釈が,広範な科学的名前変化をもたらしたので,分類学的不安定性を創出した。タキソノミー不安定性,または「分裂,塊,およびシャッフル」は,種または個体群が異なるデータ源で異なる名前でリストされているか,または異なる種または個体群が以前の名前でリストされるかもしれないので,大規模な生物多様性研究へのロジスティックな挑戦を提示する。従って,分布的および形質的データは,しばしばDNA配列データに直接リンクするのが困難であり,かつ時間消費がかかる。ここでは,RANT:Avian NCBI Taxonomyの調和を示した。RANTは,遺伝的データの主要源,NCBI GenBankにおける全ての鳥類名称を標準化するために分類学的な調整を,広く利用され,規則的に更新された鳥類分類学:eBird/Clementsに応用する。GenBankによって使用された14,341の鳥類種または亜種名のうち,11,031の名前は,6百万のヌクレオチド配列にリンクしたeBird/Clements名前と直接整合した。GenBankにおける残りのユニークな鳥類名について,Avibase分類概念,世界におけるCornells Birdsにおける分類学的記述,およびDNA配列メタデータを用いて,対応するeBird/Clements名を同定した。再構成された名前は,GenBank上のすべての鳥類配列のおよそ9%の600,000のヌクレオチド配列にリンクした。eBird/Clements名称のほぼ10%は,2つ以上のGenBank名でリストされたヌクレオチド配列を持っていた。鳥類のGenBank命名はオープンソースであり,GitHubで利用可能であり,将来の年間eBird/Clements分類学的更新に対応するように更新できる。GenBank上の鳥類名称のLAY SUMMARY-23%は,eBird/Clementsと合致せず,GenBank上の広く使用された標準化鳥類分類-600,000ヌクレオチド配列は,eBird/Clements名称のeBird/Clements-10%とマッチしない名前と関係があり,GenBankデータに対する非標準化名目使用に関連した困難を緩和するためのオープンソース分類学的再調整を提供する。”eBird/Clements名”のeBird/Clements-10%にマッチしない名前と関係がある。【JST・京大機械翻訳】
