低エネルギー潜在空間による分子配座異性体探索【JST・京大機械翻訳】

Guo Xiaomi; Fang Lincan; Xu Yong; Duan Wenhui; Patrick Rinke; Todorovic Milica; Chen Xi

プレプリント

J-GLOBAL ID：202202216359188347 整理番号：22P0310662

低エネルギー潜在空間による分子配座異性体探索【JST・京大機械翻訳】

Molecular conformer search with low-energy latent space

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発行年： 2022年03月26日プレプリントサーバーでの情報更新日： 2022年03月26日
JST資料番号： O7000B 資料種別：プレプリント
記事区分：プレプリント発行国：アメリカ合衆国 (USA) 言語：英語 (EN)

多くの自由度を有する分子に対する量子力学的精度を有する低エネルギー配座異性体の同定は挑戦的である。本研究では,分子二面角を特徴として用いて,変分自己エンコーダ(VAE)と呼ばれる生成モデルを有する潜在空間における分子配座異性体探索を実行する可能性を探求した。より有益なデータを生成するために,低エネルギー分子構成に向けてVAEをバイアスした。この方法で,低エネルギーポテンシャルエネルギー面のための信頼できるエネルギーモデルを効果的に構築できる。エネルギーモデルを作成した後,局所最小立体配座を抽出し,構造最適化でそれらを精密化した。5~9の探索次元を有する有機分子の低エネルギー潜在空間(LOLS)構造探索法を試験し,ベンチマークした。これらの結果は以前の研究と一致した。【JST・京大機械翻訳】

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, , , , 【Automatic Indexing@JST】

分子の立体配置・配座

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