系統的モデル縮小は生化学サブネットワークにおける外因性雑音の動力学を捕捉する【JST・京大機械翻訳】

Bravi Barbara; Rubin Katy J.; Sollich Peter

プレプリント

J-GLOBAL ID：202202216502626261 整理番号：22P0124695

系統的モデル縮小は生化学サブネットワークにおける外因性雑音の動力学を捕捉する【JST・京大機械翻訳】

Systematic model reduction captures the dynamics of extrinsic noise in biochemical subnetworks

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発行年： 2020年03月19日プレプリントサーバーでの情報更新日： 2020年07月01日
JST資料番号： O7000B 資料種別：プレプリント
記事区分：プレプリント発行国：アメリカ合衆国 (USA) 言語：英語 (EN)

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より大きな生化学反応ネットワーク,例えば複合体形成と解離反応を含む蛋白質相互作用ネットワーク,のサブネットワークの動力学を記述する一般的問題を考察した。ネットワークの残りから生じる確率の「外因的」源を理解するために,モデル縮小戦略の使用を提案した。提案アプローチは,投影法と経路積分によって導かれるサブネットワーク動的方程式に基づいている。結果は,サブネットワークにおける生化学事象の確率的性から,内因性ノイズの上と上において,細胞生化学反応において実験的に観察される外因性ノイズの異なる成分の原理的誘導を提供した。初期過渡現象,長時間プラトー,時間相関,乗法雑音項および非線形雑音伝搬を含む,異なる外因性雑音成分の相対的重要性を系統的に評価するために,いくつかの中間近似を検討した。最良の近似は,単純な蛋白質ネットワークおよび表皮成長因子受容体シグナル伝達ネットワークに関する定量的試験において優れた精度を達成した。【JST・京大機械翻訳】

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, , , , 【Automatic Indexing@JST】

反応速度論・触媒一般 , 理論生物学一般 , 生物物理学一般

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