養殖バーラムンディにおけるLates calcarifer herpesvirus(LCHV)の検出のためのSYBRグリーン定量的PCRアッセイの開発【JST・京大機械翻訳】

Meemetta, W.; Domingos, J. A.; Dong, H. T.; Senapin, S.

プレプリント

J-GLOBAL ID：202202216618975166 整理番号：22P0232539

養殖バーラムンディにおけるLates calcarifer herpesvirus(LCHV)の検出のためのSYBRグリーン定量的PCRアッセイの開発【JST・京大機械翻訳】

Development of a SYBR Green quantitative PCR assay for detection of Lates calcarifer herpesvirus (LCHV) in farmed barramundi

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発行年： 2020年04月25日プレプリントサーバーでの情報更新日： 2020年04月25日
JST資料番号： O7001B 資料種別：プレプリント
記事区分：プレプリント発行国：アメリカ合衆国 (USA) 言語：英語 (EN)

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Lates calcariferヘルペスウイルス(LCHV)は,東南アジアにおける養殖バーラムジの新しいウイルスである。しかし,LCHVには迅速検出法が利用できる。したがって,本研究はLCHVのための迅速定量的PCR(qPCR)検出法を開発し,バーラムジ農業諸国における疾患診断および監視のための公共にタイムリーに利用できる。LCHV推定主要エンベロープ蛋白質コード遺伝子(MEP)の93bp断片を標的とする新規設計プライマーセットを用いて,SYBRグリーンベースqPCRアッセイを開発し最適化した。確立したプロトコルは,スパイクされたホストDNAを含む反応におけるDNA鋳型の{マイクロ}lあたり10のウイルスコピーの低さを検出することができた。宿主から抽出したゲノムDNAと共通水生病原体(12細菌および3ウイルス)との交差増幅は観察されなかった。臨床サンプルによる本法の検証試験は,ウイルスが臨床的に病気の魚の複数の器官で検出されたが,健康な魚では検出されないことを明らかにした。したがって,バーラムジ農業諸国は,産業への悪影響を防止するための循環を理解するために,LCHVのための能動的監視を直ちに開始するべきであることを推薦する。LCHV C_LIO_LI qPCR法の検出のための新しいSYBR Green qPCR法は,ホストC_LIO_LIからゲノムDNAをスパイクした場合の10コピーの検出限界を持ち,LCHVはLCHV C_LIO_LIValidationに高度に特異的であり,LCHVは,qPCR検出C_LIのための最良の器官のフィンと脳を有する複数の器官から検出されることを,臨床サンプルによるLCHV C_LIO_LIValidationに示した。【JST・京大機械翻訳】

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ウイルスによる動物の伝染病 , 微生物検査法

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