溶液中の蛋白質四次構造は多重型の混合である【JST・京大機械翻訳】

Marciano, S.; Debabrata, D.; Listov, D.; Fleishman, S. J.; Sonn-Segev, A.; Mertens, H.; Busch, F.; Kim, Y.; Harvey, S. R.; Wysocki, V. H.; Schreiber, G.

プレプリント

J-GLOBAL ID：202202216905650502 整理番号：22P0326037

溶液中の蛋白質四次構造は多重型の混合である【JST・京大機械翻訳】

Protein Quaternary Structures in Solution are a Mixture of Multiple forms

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発行年： 2022年03月31日プレプリントサーバーでの情報更新日： 2022年03月31日
JST資料番号： O7001B 資料種別：プレプリント
記事区分：プレプリント発行国：アメリカ合衆国 (USA) 言語：英語 (EN)

半分以上の蛋白質はホモまたはヘテロオリゴマー構造を形成した。実験的に決定した構造は蛋白質オリゴマ状態の決定においてしばしば考慮されているが,静的構造は異なる四次形間の動的平衡を誤っている。問題はホモオリゴマで悪化し,そこではオリゴマ状態が特性化するのが困難であった。ここでは,天然質量分析(MS),質量分析(MP),サイズ排除クロマトグラフィー(SEC)および小角X線散乱(SAXS)により,広範囲の蛋白質濃度および溶液にわたる17の異なる細菌蛋白質のオリゴマ状態を再評価し,多くのオリゴマ状態を示すことを見出した。驚くべきことに,多くの蛋白質はオリゴマ状態間の質量作用駆動平衡を示さなかった。約半分の蛋白質に対して,公的に利用可能なデータベースで記述された予測オリゴマ型は,溶液中の蛋白質四次構造の複雑性を過小評価した。逆に,AlphaFold Multimerは,ほとんどの蛋白質に対する潜在的多量体状態の正確な記述を提供し,多くの蛋白質の溶液状態に関する不確実性の解決を助けることができることを示唆した。【JST・京大機械翻訳】

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, , , , 【Automatic Indexing@JST】

蛋白質・ペプチド一般 , 分子構造

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