細胞オートマトン(CA)モデルによるコロナウイルスエンベロープ蛋白質の解析【JST・京大機械翻訳】

Hazari Raju; Chaudhuri P Pal

プレプリント

J-GLOBAL ID：202202217037293419 整理番号：22P0294364

細胞オートマトン(CA)モデルによるコロナウイルスエンベロープ蛋白質の解析【JST・京大機械翻訳】

Analysis of Coronavirus Envelope Protein with Cellular Automata (CA) Model

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発行年： 2022年01月15日プレプリントサーバーでの情報更新日： 2022年01月15日
JST資料番号： O7000B 資料種別：プレプリント
記事区分：プレプリント発行国：アメリカ合衆国 (USA) 言語：英語 (EN)

SARS Covid (2003 CoV)およびMERS Covid(2012 MERS)と比較してSARS Covid(2019 CoV-2)の有意に高い伝達性の原因は,構造蛋白質で報告されている変異,およびウイルス複製,集合,および脱落に対する非構造蛋白質(nsps)およびアクセサリー蛋白質(ORF)により果たされる役割に起因する。エンベロープ蛋白質Eは最小長さの4つの構造蛋白質の1つである。最近の研究は,感染細胞から輸送されたビリオンのアセンブリを含むウイルスライフサイクルにおけるエンベロープ蛋白質によって果たされる重要な役割を確認した。しかし,エンベロープ蛋白質の高度に複雑なウイルス-宿主相互作用の決定因子,特に宿主ゴルジ複合体は,十分に特性化されていない。長さ75及び76アミノ酸のCoV-2及びCoVエンベロープ蛋白質は4アミノ酸部位で異なった。位置70の付加的アミノ酸Gly(G)はCoV長76を作った。CoV-2の位置69のアミノ酸Rの代わりにCoVの位置69~70のアミノ酸対EGが,現在の研究における主要な決定因子として同定された。本論文では,蛋白質鎖対の機能的に重要な領域におけるCoVの野生および変異体とCoV-2の野生型および変異体の構造/機能を比較するための計算モデルの設計に焦点を当てた。CoV-2とCoVのCAMLモデルパラメータの違いは,宿主ゴルジ複合体とのウイルスの相互作用に関してエンベロープ蛋白質の構造及び機能における偏差を特徴付けると仮定した。そして,この差はそれらの伝達性の差異に反映された。仮説は,病気細胞貧血に関連するヒトHBBベータグロビンヘモグロビン蛋白質に関する単一点突然変異研究,(ii)最近の出版で報告されたCovid-2感染患者のエンベロープ蛋白質の変異体,から検証された。【JST・京大機械翻訳】

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ウイルスの生化学

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