DeepPlnc:高精度植物lncRNA発見のためのバイモーダル深層学習【JST・京大機械翻訳】

Ritu,; Gupta, S.; Sharma, N. K.; Shankar, R.

プレプリント

J-GLOBAL ID：202202217146127839 整理番号：22P0029513

DeepPlnc:高精度植物lncRNA発見のためのバイモーダル深層学習【JST・京大機械翻訳】

DeepPlnc: Bi-modal Deep Learning for Highly Accurate Plant lncRNA Discovery

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発行年： 2022年05月30日プレプリントサーバーでの情報更新日： 2022年05月30日
JST資料番号： O7001B 資料種別：プレプリント
記事区分：プレプリント発行国：アメリカ合衆国 (USA) 言語：英語 (EN)

ここでは,配列および構造特性を用いて,高精度で植物lncRNAを同定するために,バイモーダルCNNベースの深層学習システム,DeepPlncを提示した。既存のソフトウェアのほとんどと異なり,それは境界の曖昧さと不完全なシーケンスの条件でさえ正確に機能する。それは,多数の検証事例でテストされたとき,>98%のブリーディング精度の間,性能計量のために一貫して高いスコアを記録した。ベンチマーキングの間,それは,すべての比較ツールを一貫して上回って,第2の最良性能ツール(p値<<0.01)から4.6%-10.3%の範囲で非常に有意なリードを維持した。深いPlncは,再び,既存のツールよりゲノムおよびトランスクリプトームアノテーション目的に対する非常に優れた適合性を示唆する,himayayan種のde novo集合トランスクリプトームを注釈するために使用した。深いPlncは,https://scbb.ihbt.res.in/DeepPlnc/でウェブサーバおよびスタンドアロンプログラムとして自由に利用可能になった。【JST・京大機械翻訳】

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, , , , , , 【Automatic Indexing@JST】

遺伝子発現 , 分子・遺伝情報処理

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