単一細胞RNA-seq研究の症例対照研究【JST・京大機械翻訳】

Petukhov, V.; Igolkina, A. A.; Rydbirk, R.; Mei, S.; Christoffersen, L.; Khodosevich, K.; Kharchenko, P.

プレプリント

J-GLOBAL ID：202202217205106905 整理番号：22P0318276

単一細胞RNA-seq研究の症例対照研究【JST・京大機械翻訳】

Case-control analysis of single-cell RNA-seq studies

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発行年： 2022年03月18日プレプリントサーバーでの情報更新日： 2022年03月18日
JST資料番号： O7001B 資料種別：プレプリント
記事区分：プレプリント発行国：アメリカ合衆国 (USA) 言語：英語 (EN)

単一細胞RNA-seq(scRNA-seq)アッセイは,基礎生物学と臨床適用研究の両方で特異的仮説を検討するためにますます利用されている。そのような研究の設計は,疾患症例や健康対照者,または治療やプラセボなどの2つ以上のグループの試料間の比較にしばしば減少できる。scRNA-seqサンプルのグループ間の比較分析は,付加的統計的考察をもたらし,現在,この一般的なシナリオに対処するツールが不足している。比較設計による経験に基づいて,ここでは,scRNA-seqサンプルコホートの統計的試験,探索および可視化を行うための計算スイート(Cacoa-case-control analysis)を提示した。多重例データセットを用いて,これらの技術の適用が付加的洞察を提供し,個人間変動,限られたサンプルサイズ,およびデータの高次元から発する問題を避けることができることを実証した。【JST・京大機械翻訳】

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, , , , 【Automatic Indexing@JST】

分子・遺伝情報処理 , 遺伝子の構造と化学 , 遺伝子発現

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