プレプリント
J-GLOBAL ID：202202217305449508   整理番号：22P0321303

メラノーマに対する高い多遺伝子リスクは生存改善と関連する【JST・京大機械翻訳】

Higher polygenic risk for melanoma is associated with improved survival
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著者 (18件)：
Seviiri, M.

Seviiri, M. について

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Scolyer, R. A.

Scolyer, R. A. について

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Bishop, T. D.

Bishop, T. D. について

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Iles, M. M.

Iles, M. M. について

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Lo, S. N.

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Stretch, J. R.

Stretch, J. R. について

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Saw, R. P. M.

Saw, R. P. M. について

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Nieweg, O. E.

Nieweg, O. E. について

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Shannon, K. F.

Shannon, K. F. について

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Spillane, A. J.

Spillane, A. J. について

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Gordon, S. D.

Gordon, S. D. について

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Olsen, C. M.

Olsen, C. M. について

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Whiteman, D. C.

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Landi, M. T.

Landi, M. T. について

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Thompson, J. F.

Thompson, J. F. について

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Long, G. V.

Long, G. V. について

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MacGregor, S.

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Law, M. H.

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資料名：
medRxiv

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発行年： 2022年03月25日  プレプリントサーバーでの情報更新日： 2022年03月25日
JST資料番号： O7002B  資料種別： プレプリント
記事区分： プレプリント  発行国： アメリカ合衆国 (USA)  言語： 英語 (EN)
抄録/ポイント：
抄録/ポイント
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【背景】診断時の原発性腫瘍の厚さおよび腫瘍ステージのような皮膚黒色腫(CM)からの生存に対する良く知られた予後因子があり,生存を決定する際の生殖系列遺伝因子の役割はよく理解されていない。【目的】黒色腫特異的生存(MSS)のゲノムワイド関連研究(GWAS)メタ分析を行い,CM感受性多遺伝子リスクスコア(PRS)がMSSと関連するかどうかを試験する。方法:Melanoma Institute オーストラリア(MIA;黒色腫の57662人の患者,黒色腫の800人の死亡)およびUK Biobank(UKB:5,黒色腫の241人の死亡)からのデータを用い,MSSの2つのCox比例ハザードGWASを行った。GWASは,年齢,性別および最初の10の遺伝主成分に対して調整され,固定効果逆分散加重メタ分析において結合された。Leeds Melanoma Cohort(LMC;1,947名の黒色腫患者,370名の黒色腫死亡)において有意な(P<5x10 ̄-8)結果を検討した。また,大規模独立GWASメタ解析(23,913例,342,870対照)を用いてCM感受性PRSを開発した。PRSは,LMCにおける複製により,MIAおよびUKBコホートにおけるMSSとの関連について試験した。【結果】2つの遺伝子座は,染色体1のリードSNP rs41309643(G対立遺伝子頻度1.6%,ハザード比[HR]2.09,95%信頼区間[CI]1.61-2.71,P=2.08x10-8),および染色体7のrs75682113(C対立遺伝子頻度1.8%,HR=2.38,95%CI=1.77-3.21,P=1.07x10-8)で,MSSと有意に関連していた。(C対立遺伝子頻度1.6%,ハザード比[HR]2.09,95%信頼区間[CI]1.61-2.71,P=2.08x10-8)..7染色体1,2つの遺伝子座は,MSSと有意な関連があった。また,染色体1とrs75682113(C対立遺伝子頻度1.8%,HR=2.38,95%CI=1.77-3.21,P=1.07x10-8)。LMCにおけるSNP複製(P>0.05)はないが,rs75682113は複合発見と複製セットで有意に関連し,追加コホートでの確認を必要とした。診断,性別および最初の10主成分の年齢を調整した後,CM感受性PRSにおける1標準偏差増加は,発見メタ分析におけるMSSの改善と関連していた(HR=0.88,95%CI=0.83~0.94,P=6.93x10 ̄-5;I ̄2=88%)。PRSとの関連はLMCにおいて複製されなかったが(P>0.05),発見と複製結果のメタ分析においてMSSと有意に関連していた。結論:MSSと潜在的に関連する2つの遺伝子座を見出し,CM発生に対する生殖系列遺伝的感受性の増加がMSSの改善と関連する可能性がある証拠を見出した。【JST・京大機械翻訳】
シソーラス用語：
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