深いキネトプラストゲノム分析はTrypanosoma brucei gambiense特異的ミニサークルを検出するための新規分子アッセイをもたらす【JST・京大機械翻訳】

Geerts, M.; Chen, Z.; Bebronne, N.; Savill, N. J.; Schnaufer, A.; Buscher, P.; Van Reet, N.; Van den Broeck, F.

プレプリント

J-GLOBAL ID：202202217328181804 整理番号：22P0321586

深いキネトプラストゲノム分析はTrypanosoma brucei gambiense特異的ミニサークルを検出するための新規分子アッセイをもたらす【JST・京大機械翻訳】

Deep kinetoplast genome analyses result in a novel molecular assay for detecting Trypanosoma brucei gambiense-specific minicircles

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著者 (8件)： , , , , , , ,
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発行年： 2022年03月15日プレプリントサーバーでの情報更新日： 2022年03月15日
JST資料番号： O7002B 資料種別：プレプリント
記事区分：プレプリント発行国：アメリカ合衆国 (USA) 言語：英語 (EN)

世界保健機関は,2030年までに伝染除去のために,Trypanosoma brucei gambiense(Tbg)ヒトアフリカトリパノソーマ症を目標とした。Tbg1型(Tbg1)寄生虫を特異的に検出する高感度分子標識は,この目標の達成を助ける重要なツールである。ここでは,Trypanosoma brucei寄生虫のキネトプラスト内の豊富なミトコンドリアミニサークルを標的化することにより,Tbg1感染の分子診断を改善することを目的とした。全細胞DNA抽出物の次世代配列決定を用いて,著者らはキネトプラストゲノムを組み立て,注釈付けし,38の動物およびヒト感染トリパノソーマ株におけるミニサークル配列多様性を調べた。コンピュータ分析は,Tbg1特異的として合計241のミニサークル配列クラスを認識し,そのうち3つは18の研究されたTbg1株によって共有された。次に,1つのTbg1特異的ミニサークルと3つのTbg1特異的またはトリパノゾロン特異的マーカーを標的とする新規多重定量的PCRアッセイ(g-qPCR3)を開発した。分子分析は,ミニサークルに基づくアッセイが動物に適用可能であり,TgsGPに基づくアッセイと特異的であり,Tbg1の分子検出のための現在のゴールデン標準であることを明らかにした。標的ミニサークルのコピー数中央値は8と等しく,このミニサークルに基づくアッセイがTbg1寄生虫の高感度検出に使用できることを示唆した。最後に,標的ミニサークル配列のアノテーションは,それが寄生虫の生存に必須の遺伝子をコード化し,従って自然Tbg1集団で保存されるであろうことを示した。これらの結果は,著者らのミニサークルベースのアッセイが,ヒトと動物におけるTbg1感染の信頼できる高感度検出のための有望な新しいツールであることを実証した。【JST・京大機械翻訳】

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, , , 【Automatic Indexing@JST】

遺伝子の複製 , 分化,増殖,成長,生殖 , 生物学的機能

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