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J-GLOBAL ID：202202217388371321   整理番号：22A0587814

重症急性呼吸器症候群コロナウイルス2のNsp9レプリカーゼとスパイク蛋白質を標的とするための構造ベース薬物再精製【JST・京大機械翻訳】

Structure-based drug repurposing for targeting Nsp9 replicase and spike proteins of severe acute respiratory syndrome coronavirus 2

著者 (8件)： Chandel Vaishali (Amity Institute of Molecular Medicine & Stem Cell Research (AIMMSCR), Amity University Uttar Pradesh, Noida, India) ,  Sharma Prem Prakash (Laboratory for Translational Chemistry and Drug Discovery, Department of Chemistry, Hansraj College, University of Delhi, Delhi, India) ,  Raj Sibi (Amity Institute of Molecular Medicine & Stem Cell Research (AIMMSCR), Amity University Uttar Pradesh, Noida, India) ,  Choudhari Ramesh (Center of Emphasis in Cancer, Paul L. Foster School of Medicine, Department of Molecular and Translation Medicine, Texas Tech University Health Sciences Center, El Paso, TX, USA) ,  Choudhari Ramesh (Shri B. M. Patil Medical College, Hospital and Research Centre, BLDE (Deemed to be University), Vijayapura, India) ,  Rathi Brijesh (Laboratory for Translational Chemistry and Drug Discovery, Department of Chemistry, Hansraj College, University of Delhi, Delhi, India) ,  Rathi Brijesh (Laboratory of Computational Modelling of Drugs, South Ural State University, Chelyabinsk, Russia) ,  Kumar Dhruv (Amity Institute of Molecular Medicine & Stem Cell Research (AIMMSCR), Amity University Uttar Pradesh, Noida, India)
資料名： Journal of Biomolecular Structure and Dynamics  (Journal of Biomolecular Structure and Dynamics)
巻： 40  号： 1  ページ： 249-262  発行年： 2022年 
JST資料番号： W5935A  ISSN： 0739-1102  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： イギリス (GBR)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 薬剤再精製は,重症急性呼吸器症候群コロナウイルス2(SARS-CoV-2)により生じる,新しいコロナウイルス疾患2019に対する薬剤開発の迅速で効率的な方法になる。SARS-CoV-2における非構造蛋白質9(Nsp9)レプリカーゼとスパイク蛋白質を潜在的に阻害できるFDA承認薬を同定するために,分子動力学とドッキングを用いたバイオインフォマティクスアプローチを適用した。Nsp9レプリカーゼ及びスパイク蛋白質に対する抗ウイルス,抗マラリア,抗寄生虫,抗真菌,抗結核及び活性フィトケミカルを含むFDA承認化合物の仮想スクリーニングを行った。選択したヒット化合物を,それらの最も高い結合エネルギーおよび好ましい吸収,分布,代謝および排泄(ADME)プロファイルに基づいて同定した。アルギニンバソプレシン拮抗薬であるコンビバプタンは,Nsp9レプリカーゼの活性部位に存在するアミノ酸残基と最も高い結合エネルギー(-8.4Kcal/mol)と最大安定性を示した。C型肝炎ウイルスの非ヌクレオシド阻害剤であるテゴブビルはスパイク蛋白質の活性部位で最も高い結合エネルギー(-8.1Kcal/mol)と共に最大安定性を示した。分子ドッキングスコアは,Schroedingerを用いた分子動力学によってさらに検証され,水架橋,疎水性相互作用,およびH結合を介して,それらの活性部位でのリガンドの強い安定性を支持した。本知見は,SARS-CoV-2に対する潜在的治療薬としてのコンバプタンとテゴブビルを示唆する。さらなるin vitroおよびin vivo検証および評価は,これら薬剤化合物がNsp9複製およびスパイク蛋白質をどのように標的化するかを確立するのに保証される。図式図はPlease refer to the publisher for the copyright holders. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： ヌクレオシド ,  マラリア ,  *薬物 ,  活性部位 ,  真菌類 ,  ドラッグデザイン ,  複製【遺伝】 ,  *RNAレプリカーゼ ,  アミノ酸残基 ,  ターゲティング ,  in vitro実験
準シソーラス用語： *コロナウイルス ,  リガンド ,  バイオインフォマティクス ,  ADME , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (6件)： SARS-CoV-2 ,  Nsp9レプリカーゼ ,  スパイク蛋白質 ,  分子ドッキング ,  薬物設計 ,  薬物の再利用

分類 (2件)： ウイルスの生化学  (EG04030F) ,  ウイルス感染の生理と病原性  (EG04042Y)

タイトルに関連する用語 (6件)： 重症急性呼吸器症候群コロナウイルス2 ,  レプリカーゼ ,  スパイク蛋白質 ,  標的 ,  薬物 ,  精製