Pumasによる加速予測健康管理解析,高性能医薬品モデリングおよびシミュレーションプラットフォーム【JST・京大機械翻訳】

Rackauckas, C. V.; Ma, Y.; Noack, A.; Dixit, V.; Mogensen, P.; Elrod, C.; Tarek, M.; Byrne, S.; Maddhashiya, S.; Calderon, J. B. S.; Hatherly, M.; Nyberg, J.; Gobburu, J.; Ivaturi, V.

プレプリント

J-GLOBAL ID：202202217541494875 整理番号：22P0254329

Pumasによる加速予測健康管理解析,高性能医薬品モデリングおよびシミュレーションプラットフォーム【JST・京大機械翻訳】

Accelerated Predictive Healthcare Analytics with Pumas, A High Performance Pharmaceutical Modeling and Simulation Platform

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著者 (14件)： , , , , , , , , , , , , ,
資料名：
発行年： 2022年03月20日プレプリントサーバーでの情報更新日： 2022年03月20日
JST資料番号： O7001B 資料種別：プレプリント
記事区分：プレプリント発行国：アメリカ合衆国 (USA) 言語：英語 (EN)

薬理学的モデリングは,投与用量,組織曝露,望みと望ましくない効果,および患者の危険因子の間の因果的な定量的関係を確立する。これらのモデルは,薬剤開発を危険にさらし,正確な医学決定を誘導するために採用される。しかし,今日の不均一ビッグデータと複雑なモデルを処理するためには,薬理学的ツールは設計されていない。ヘルスケアにおける革新と準備を促進するために,ドメイン特異的モデリングと最新の解析による統合を容易にするプラットフォームを設計した。Pumaは劇的な性能進歩による推定方法論を示す。頻繁な不連続性に対してロバストである係数最適化高次積分器および新しい自動剛性検出アルゴリズムのような新しいODEソルバアルゴリズムは,薬理学的応用で見られる広範囲の剛性および非剛性システムにわたって,中央値4x性能改善を生じさせる。これらの方法は,JITコンパイラ技術(例えば,静的サイズの最適化とフォワードモード自動識別による離散的感度解析)と結合して,さらに,解決とパラメータ推定プロセスの精度と性能を強化する。これらの技法の全てを,検証済み臨床試験投与メカニズムと非コンパートメント分析(NCA)セットと組み合わせると,NLMEフィッティングのような実際の応用は,同じ精度を保持しながら,中央値81x加速を見ることを示した。一方,最適実験計画のように,より少ない事前ソフトウェア最適化の領域において,著者らは,競争者に関して,大きさ性能強化のオーダーを見た。さらに,Pumaは,日々のユーザ活動の生産性を高めるように自動化され,設計されたいくつかのワークフローとこれらの技術的進歩を組み合わせる。総合して,次世代精度解析に対する高速薬局的モデリングフレームワークを示した。【JST・京大機械翻訳】

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, , , 【Automatic Indexing@JST】

薬物の相互作用 , ディジタル計算機ハードウェア一般 , 腫ようの化学・生化学・病理学 , 計算機シミュレーション , 遺伝子操作

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