プレプリント
J-GLOBAL ID:202202217730473374   整理番号:22P0313824

IFI27とAPOC2のScRNA-seq発現は健康なBALFにおける4つの肺胞マクロファージスーパークラスターを同定する【JST・京大機械翻訳】

ScRNA-seq Expression of IFI27 and APOC2 Identifies Four Alveolar Macrophage Superclusters in Healthy BALF
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資料名:
発行年: 2022年06月13日  プレプリントサーバーでの情報更新日: 2022年06月13日
JST資料番号: O7001B  資料種別: プレプリント
記事区分: プレプリント  発行国: アメリカ合衆国 (USA)  言語: 英語 (EN)
抄録/ポイント:
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肺胞マクロファージ(AM)は気道と肺胞の内腔表面に存在し,細胞デブリと病原体を摂取し,炎症反応を調節することにより適切なガス交換を確実にする。したがって,AMs,間質マクロファージ(IMs),および動員された単球によって果たされる不均一性および多様な役割を理解することは,気道疾患を治療するために重要である。著者らは,IFI27とAPOC2遺伝子の発現に基づいて,4つの健康と3つの非炎症嚢胞性線維症被験者から113,213の気管支肺胞洗浄細胞に関する単一細胞RNA塩基配列決定を行い,FOLR2+SELENOP+とSPP1+PLA2G7+IMs,単球サブタイプ,および樹状細胞1(DC1),DC2,migDC,形質細胞DC,リンパ球,上皮細胞,および4つのAMスーパークラスター(家族性)を同定した。これらの4つのAMファミリーは,それらの差別的に発現された遺伝子(s):IGF1,CCL18,CXCL5,コレステロール,ケモカイン,メタロチオネイン,インターフェロンおよび小クラスタAMs後に命名された少なくとも8つの異なる機能的メンバー(サブクラスタ)を持ち,化学ケモカインクラスターは,ケモカインのユニークな組み合わせを選択的に発現する各サブクラスターとさらに分割する。不均一性に加えて,最も顕著な観測の一つは,全てのAM超クラスターと個体にわたって,比較的等しい比のAMファミリーメンバーの保存である。転写データと総Seq技術を用いて,動員した単球から常在AMを区別する細胞表面マーカーを調べた。最後に,他のAMデータセットをデータセットに投影した。COVID-19に感染した個体のAMサブクラスタの変化とともに,同様のAMスーパークラスターと機能的サブクラスタが観察された。全体として,AMサブクラスターの機能的特殊化は,明確なプログラミング状態を有する高度に調節されたAMニッチがあり,労働の明確な分割を強調する。【JST・京大機械翻訳】
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分類 (3件):
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生体防御と免疫系一般  ,  呼吸器の疾患  ,  呼吸器の基礎医学 
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