HtrAプロテアーゼの反復,モジュール構造【JST・京大機械翻訳】

Merski, M.; Macedo-Ribeiro, S.; Wieczorek, R. M.; Gorna, M. W.

プレプリント

J-GLOBAL ID：202202217740432889 整理番号：22P0343129

HtrAプロテアーゼの反復,モジュール構造【JST・京大機械翻訳】

The Repeating, Modular Architecture of the HtrA Proteases

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発行年： 2022年04月29日プレプリントサーバーでの情報更新日： 2022年04月29日
JST資料番号： O7001B 資料種別：プレプリント
記事区分：プレプリント発行国：アメリカ合衆国 (USA) 言語：英語 (EN)

保存,26残基配列[AA(X2)[A/G][G/L](X2)GDV[I/L](X2)[V/L]NGE(X1)V(X6)]及び対応する構造反復モジュールを,公的に利用可能な構造の非冗長セット(N=20)を用いてHtrAプロテアーゼファミリー内で同定した。反復自体は配列完全から離れているが,それらは1031残基あたり1回だけランダムに起こると予想されるレベルで1つの蛋白質内で同定された3つ以上の反復で統計的に有意なレベルへの顕著な保存を有した。この配列反復は,セリンプロテアーゼのPA clan構造のコアに存在する6つの鎖逆平行{ベータ}バレルモジュールと関連し,一方,このモジュールの修飾バージョンはPDZ様ドメインで同定できた。自動構造アラインメント法は,これらの{ベータ}バレルを重ね合わせるのに困難があったが,標的ヒトHtrA2構造の使用は,これらのモジュールが2[A](平均および中央値)未満の構造セットにわたって平均RMSDを有することを示した。著者らの知見は,複雑な蛋白質がより単純なペプチドモチーフとドメインの重複を介して起こるというDayoffs仮説を支持する。【JST・京大機械翻訳】

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酵素一般 , 微生物の生化学

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