プレプリント
J-GLOBAL ID:202202217933474783   整理番号:22P0031824

野菜ハモグリ(Liriomyza sativa)のゲノムワイドSNP:最近のオーストラリア侵入への洞察【JST・京大機械翻訳】

Genome-wide SNPs of vegetable leafminer, Liriomyza sativae: insights into the recent Australian invasion
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資料名:
発行年: 2022年01月06日  プレプリントサーバーでの情報更新日: 2022年01月06日
JST資料番号: O7001B  資料種別: プレプリント
記事区分: プレプリント  発行国: アメリカ合衆国 (USA)  言語: 英語 (EN)
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Liriomyza sativae,野菜のハナミナは,南極を除くすべての大陸を現在定着しているアメリカから,本来深刻な農業害虫である。2015年には,L.sativaeはオーストラリア本土に到着し,国の北東のCapeヨーク半島で確立された。ここでは,オーストラリアにおけるこの害虫の潜在的起源を明らかにし,その地球規模の侵入史の再構築に寄与するため,二重消化制限部位関連DNA配列決定(ddRAD-seq)により生成されたゲノムワイド一塩基多型(SNP)に基づくL.sativaの遺伝的変異を評価した。主成分分析(PCA)の結果は,オーストラリア本土個体群がTorres海峡からの個体群に遺伝的に近接しており,BaliとPapua New Guinea(PNG)との接続を持ち,一方,アジアとアフリカからの個体群は,より遠隔に関連することを示唆した。ハワイはアジア,アフリカおよびオーストラリアの個体群と遺伝的に異なった。共同分析は,Torres海峡からオーストラリア本土への遺伝子流動のシグナルを示し,一方インドネシア/PNGはTorres海峡への初期侵入のありそうな発生源であった。さらに,混合分析は,Torres海峡からのL.sativaeが,オーストラリア本土に広がった多重源に由来する遺伝的多様性を有することを明らかにした。アジア/アフリカ産のL.sativae系統は密接に関連し,共産を共有する可能性がある。距離(IBD)による分離が広い地球規模で見いだされたが,小さな領域内では見出されず,ヒト媒介因子がこの害虫の局所的広がりに寄与することを示唆した。全体として,著者らの知見は,この世界的害虫の分布を制限することを目的とした検疫手段における挑戦を強調する。【JST・京大機械翻訳】
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分類 (2件):
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遺伝子の構造と化学  ,  昆虫・ダニによる植物被害 

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