分配関数のクラスタ展開により明らかにされた蛋白質における重要な相互作用パターン【JST・京大機械翻訳】

Tajana M.; Trovato A.; Tiana G.

プレプリント

J-GLOBAL ID：202202217984405662 整理番号：22P0328452

分配関数のクラスタ展開により明らかにされた蛋白質における重要な相互作用パターン【JST・京大機械翻訳】

Key interaction patterns in proteins revealed by cluster expansion of the partition function

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発行年： 2022年04月08日プレプリントサーバーでの情報更新日： 2022年04月08日
JST資料番号： O7000B 資料種別：プレプリント
記事区分：プレプリント発行国：アメリカ合衆国 (USA) 言語：英語 (EN)

構造化蛋白質の天然立体配座は相互作用の複雑なネットワークにより安定化した。そのようなネットワークを構成する基本パターンを分析し,蛋白質配列設計の形成における重要性に従ってそれらをランク付けした。この目標を達成するために,配列空間における分割関数のクラスタ拡張を採用し,各クラスタの統計的重要性を数値的に評価した。この手順の重要な特徴は,それが高密度で有限なシステムに適用されることである。分割関数に最も寄与するパターンはノード数でさえサイクルであるが,クリークは典型的には有害であることを見いだした。また,各クラスタは配列エントロピーに寄与し,それは折畳みの進化設計可能性の尺度である。異なる相互作用パターンと関連したエントロピーを,実蛋白質の天然構造における存在量と比較した。【JST・京大機械翻訳】

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分子・遺伝情報処理

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