スプライシング依存性フレームシフトを用いた遺伝子発現の細胞特異的調節【JST・京大機械翻訳】

Ling, J.; Bygrave, A.; Santiago, C.; Carmen, R.; Trinh, V.; Yu, M.; Li, Y.; Han, J.; Taneja, K.; Liu, Y.; Dongmo, R.; Babola, T.; Parker, P.; Jiang, L.; Leavey, P.; Smith, J.; Vistein, R.; Gimmen, M.; Dubner, B.; Teodorescu, P.; KARANTANOS, T.; Ghiaur, G.; Kanold, P.; Bergles, D. E.; Langmead, B.; Sun, S.; Nielsen, K.; Peachey, N.; Singh, M.; Dalton, W.; Rajaii, F.; Huganir, R. L.; Blackshaw, S.

プレプリント

J-GLOBAL ID：202202218003041280 整理番号：22P0316868

スプライシング依存性フレームシフトを用いた遺伝子発現の細胞特異的調節【JST・京大機械翻訳】

Cell-specific regulation of gene expression using splicing-dependent frameshifting.

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資料名：
発行年： 2022年03月02日プレプリントサーバーでの情報更新日： 2022年03月02日
JST資料番号： O7001B 資料種別：プレプリント
記事区分：プレプリント発行国：アメリカ合衆国 (USA) 言語：英語 (EN)

正確で信頼性のある細胞特異的遺伝子デリバリーは技術的に困難である。ここでは,分離翻訳読取枠が細胞特異的代替エキソンの封入体または排除に結合する遺伝子発現を制御するためのスプライシングに基づくアプローチを報告する。候補エキソンは,数千の公的に利用可能なRNA配列決定データセットと,細胞特異性,配列保存,および局所イントロン長によるフィルタリングを分析することによって同定される。スプライシング結合発現設計(SLED)を示すこの方法は,ミニプロモーターやウイルスカプシドのような既存の技術とBoole法に組み合わせることができる。SLEDベクターは,プロモーター強度と選択性の間のトレードオフをデカップリングすることにより,精度を犠牲にすることなく構成プロモーターの強い発現を利用することができる。すべてのニューロン,光受容体または興奮性ニューロンを選択的に標的化するためにSLEDベクターを作成し,AAVを用いて送達すると特異性がin vivoで保持されることを示した。さらに,そうでなければ,特にGluA2フリップ/フロップリポーターと二重興奮性/抑制神経カルシウムインジケーターである,そうでない研究ツールを創り出すことにより,SLEDの有用性を示した。最後に,Prph2rds/rdsマウスの光受容体変性を回復させ,SF3B1変異癌細胞でアポトーシスを選択的に誘導できる腫瘍崩壊ベクターを開発することにより,SLEDの翻訳能を示した。SLED技術の柔軟性は,基礎および翻訳研究のための新しい道筋を可能にする。【JST・京大機械翻訳】

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遺伝子発現

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