抄録/ポイント：
抄録/ポイント
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【背景】GC対は一般的にAT対より安定である。GCリッチゲノムはATリッチゲノムより高温に順応することを提案した。以前の研究は,構造RNA遺伝子の成長温度とGC含有量との間に正の相関を示した。しかし,全ゲノム配列と蛋白質コード遺伝子におけるコドンのサイレント部位について,GC含量と成長温度間の関係は,長い持続性の議論にある。【結果】以前の研究よりはるかに大きいデータセット(完全に組み立てられたゲノムを有する681の細菌および155の古細菌)によって,著者らの系統発生比較分析は,細菌および古細菌構造RNA遺伝子および細菌全体のゲノム配列,染色体配列,プラスミド配列,コア遺伝子,およびアクセサリー遺伝子における最適成長温度(Topt)とGC含有量の間の正相関を示した。しかし,155の古細菌では,4倍縮退部位での全ゲノムGC含量(GCw)またはGC含量とTopとの有意な正相関は観察されなかった。1000ラウンドの681の細菌から155の試料をランダムに描いた。大部分の症例(>95%)において,ToptとゲノムGC含有量の間の正相関は,統計的に有意でなかった(P>0.05)。この結果は,小サンプルサイズが155古細菌における成長温度とゲノムGC含有量の間の正相関の欠如と以前の研究の細菌サンプルを説明するかもしれないことを示唆した。GC含量を4つのカテゴリー間で比較すると,細菌におけるGCwと成長温度の間に正の相関を示した。不完全に集合したゲノムのGCwを含めることにより,古細菌の試料サイズを303に拡大した。GCwとToptの間の正相関は,特に,GC含有量が強いUV照射によって強く形成される可能性がある好塩性古細菌を除いた後に現れる。結論:この研究は,以前の矛盾した観察を説明し,長い議論を終えた。高温で成長する原核生物は,より高いGC含有量を有する。熱適応は正の会合に対する一つの可能な説明である。一方,著者らは,熱変異誘発に応答するDNA修復の高効率が,細胞内共生生物と海洋バクテリオプランクトンで起こるようなGC含有量増加の副産物を有するかもしれないと提案する。【JST・京大機械翻訳】
