抄録/ポイント:
抄録/ポイント
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1.系統学から推定される多様化率は同定できない。与えられた系統発生に対して正確な同じ尤度スコアを持つスペシエーションと消光速度関数の無限に多くの組合せがあり,一致クラスを構築する。そのような一致クラスの特定の形状と特性はまだ研究されていない。一致クラス内のスペシエーションと消光速度関数が共通の特徴を共有するかどうかも知られていない。2.多様化レートを識別できる代わりに,それらの固有の非識別可能な性質を包含できる。一致クラスを探索するために2つの異なるアプローチを用いた。(i)特定の代替仮説の試験,および(ii)一致クラス内の代替率関数をランダムにサンプリングする。3.著者らの方法はオープンソースRパッケージACDC(https://github.com/afmagee/ACDC)に実装される。ACDCは一致クラスを探索する柔軟な手法を提供し,一致クラス内のレート関数の要約を提供する。要約は,一般的傾向,すなわち,増加,平坦または減少率を強調することができる。無限に多くの等しくありそうな多様化率関数があるが,これらは共通の特徴を共有することができる。ACDCは,非識別可能性にもかかわらず,多様化率パターンがロバストであるかどうかを評価するために使用できる。著者らの例において,著者らは,一致クラスにおけるすべてのモデルの間で一般的である多様化率変化の3つの相を明確に同定した。したがって,一致クラスは系統学から生物多様性の歴史的パターンを研究するための問題ではない。【JST・京大機械翻訳】