染色体クラスタ指向解析と組み合わせたDNAメチロームは皮膚黒色腫攻撃性の早期シグネチャを提供する【JST・京大機械翻訳】

Carrier, A.; Desjobert, C.; Ponger, L.; Lamant, L.; Bustos, M.; Torres-Ferreira, J.; Henrique, R.; Jeronimo, C.; Lanfrancone, L.; Delmas, A.; Favre, G.; Delaunay, A.; Busato, F.; Hoon, D. S. B.; Tost, J.; Etievant, C.; Riond, J.; Arimondo, P. B.

プレプリント

J-GLOBAL ID：202202218186124464 整理番号：22P0331056

染色体クラスタ指向解析と組み合わせたDNAメチロームは皮膚黒色腫攻撃性の早期シグネチャを提供する【JST・京大機械翻訳】

DNA methylome combined with chromosome cluster-oriented analysis provides an early signature for cutaneous melanoma aggressiveness

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資料名：
発行年： 2022年04月12日プレプリントサーバーでの情報更新日： 2022年04月12日
JST資料番号： O7001B 資料種別：プレプリント
記事区分：プレプリント発行国：アメリカ合衆国 (USA) 言語：英語 (EN)

異常なDNAメチル化は腫瘍のよく知られた特徴であり,転移性黒色腫と関連している。しかし,黒色腫細胞は高度に不均一であるので,腫瘍攻撃性,転移進化,および患者転帰を予測するために,影響遺伝子を使用することは挑戦的である。著者らは,一般的な攻撃的過メチル化シグネチャが腫瘍形成初期に出現し,この形質が生じる生理学的状況とは無関係に,攻撃的細胞で共有されるべきであると仮定した。対メラノーマ細胞株を以下の性質と比較した。(i)各対は1つの攻撃的対応物とその親細胞系から成り,(ii)同じ親細胞系から開始して,異なる宿主とそれらの環境(ヒト,ラット,マウス)から攻撃的細胞株をそれぞれ得た。次に,DNAメチロームプロファイルを染色体クラスター指向分析と組み合わせた多段階ゲノムパイプラインを開発した。合計229の差次的高メチル化遺伝子が,攻撃的細胞株で一般に見出された。ゲノム局在性分析は,メラノーマ患者からの組織における検証のための8つの高メチル化遺伝子プロモーターを同定し,過メチル化ピークとクラスターを明らかにした。原発性黒色腫組織で同定された5つのCpGは,生存を予測できるDNAメチル化スコアに変換された(ログランク検定,p=0.0008)。この戦略はDNAメチル化変化を含む他の疾患に普遍的に適用できる。【JST・京大機械翻訳】

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, , , 【Automatic Indexing@JST】

皮膚の腫よう , 腫ようの化学・生化学・病理学

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