韓国,ソウルにおけるCOVID-19パンデミック中の発生の原因となるヒトパラインフルエンザ3型ウイルス株の系統学的解析【JST・京大機械翻訳】

Kim, H. N.; Yoon, S. Y.; Lim, C. S.; Lee, C. K.; Yoon, J.

プレプリント

J-GLOBAL ID：202202218207083011 整理番号：22P0318321

韓国,ソウルにおけるCOVID-19パンデミック中の発生の原因となるヒトパラインフルエンザ3型ウイルス株の系統学的解析【JST・京大機械翻訳】

Phylogenetic analysis of human parainfluenza type 3 virus strains responsible for the outbreak during the COVID-19 pandemic in Seoul, South Korea

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発行年： 2022年03月16日プレプリントサーバーでの情報更新日： 2022年03月16日
JST資料番号： O7001B 資料種別：プレプリント
記事区分：プレプリント発行国：アメリカ合衆国 (USA) 言語：英語 (EN)

【背景】ヒトパラインフルエンザウイルス3(HPIV3)は,乳児および小児において急性呼吸器感染症を引き起こす主要な呼吸器病原体である。9月2021年以降,季節外HPIV3リバウンドが韓国で注目された。本研究の目的は,韓国,ソウルにおける発生に関与するHPIV3株の分子特性を分析することであった。【方法】合計61のHPIV3陽性鼻咽頭スワブ標本を10月と11月2021日に採取した。33のHPIV3陽性標本を用いて,HPIV3血球凝集素-ノイラミニダーゼ(HN)遺伝子の部分ヌクレオチド配列を,系統発生的および遺伝的距離(p-距離)分析のために以前に発表されたHN遺伝子配列と整列させた。【結果】系統樹は,すべてのソウルHPIV3菌株が系統発生サブクラスタC3にグループ分けされたことを明らかにした。しかし,これらの株はC3a系統から別々に分岐するユニークなクラスターを形成した。このクラスタはp-距離<0.001の99%ブートストラップ担体を示した。他のC3系統内の遺伝的距離は0.013(C3a)から0.023(C3c)の範囲であった。HN遺伝子の推定アミノ酸配列は,他の参照株:A22T,K31N,G387SおよびE514Kではほとんど観察されないソウルHPIV3株における4つの蛋白質置換を明らかにした。【結論】ソウルHPIV3株の系統発生解析は,菌株がサブクラスタC3内の別々のクラスタに属することを明らかにした。サブクラスターC3内の菌株間の遺伝的距離は,新しい遺伝的系統の出現を示唆する。新しい遺伝的系統の出現は,新しい流行の潜在的リスクをもたらす可能性がある。循環HPIV3株のさらなるモニタリングは,新たに発見された変異の重要性を理解するために必要である。【JST・京大機械翻訳】

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感染症・寄生虫症一般

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