A/T末端コドンの進化的保存は発現と複合体形成の共調節を反映する【JST・京大機械翻訳】

Benisty, H.; Hernandez-Alias, X.; Weber, M.; Anglada-Girotto, M.; Mantica, F.; Radusky, L.; Senger, G.; Weghorn, D.; Irimia, M.; Schaefer, M. H.; Serrano, L.

プレプリント

J-GLOBAL ID：202202218224234775 整理番号：22P0312530

A/T末端コドンの進化的保存は発現と複合体形成の共調節を反映する【JST・京大機械翻訳】

Evolutionary conservation of A/T-ending codons reflects co-regulation of expression and complex formation.

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著者 (11件)： , , , , , , , , , ,
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発行年： 2022年01月18日プレプリントサーバーでの情報更新日： 2022年01月18日
JST資料番号： O7001B 資料種別：プレプリント
記事区分：プレプリント発行国：アメリカ合衆国 (USA) 言語：英語 (EN)

背景:多様な生物において,同義コドンは,発現レベルを決定する際に重要な役割を果たすコドンバイアスとして知られる現象である異なる頻度で使用されている。しかし,発生のような細胞プログラムの表現型変化をもたらすために,数千の蛋白質コード転写物の同時ターンオーバーを促進するコドンバイアスの重要性はまだ詳細に研究されていない。結果:ここでは,A/T末端コドン選好を持つ遺伝子が協調的に発現し,哺乳類において高いコドン保存を示すことを見出した。この特徴はG/C末端コドンに富む遺伝子では観察されない。この現象のパラダイムは,RASファミリーからのKRASであり,HRAS(76%)と比較して,高いコドン保存(95%)を有するA/Tリッチ遺伝子である。また,類似したコドン組成を持つ遺伝子は,同じ蛋白質複合体の一部であり,A/T末端コドンを持つ遺伝子は,G/Cに富むものより蛋白質複合体を形成する傾向があることを見出した。A/T末端コドンを持つ遺伝子のコドン選択は脊椎動物間で保存されている。発現調節転写物の特徴であるコドン保存は,A/T末端コドンを読むtRNAイソアクセプタの高発現変動と協調にリンクすることを提案する。結論:我々のデータは,細胞がA/T末端コドンを利用して,蛋白質コード転写物の協調的で微調整された変化を生成することを示す。この調節は組織特異的及び個体発生特異的発現に寄与し,例えばタイムリーな蛋白質複合体形成を促進することを示唆した。【JST・京大機械翻訳】

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遺伝子発現

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