ポチウイルス遺伝的多様性の成形における内因性障害の寄与の解析【JST・京大機械翻訳】

Lafforgue, G.; Michon, T.; Charon, J.

プレプリント

J-GLOBAL ID：202202218252773304 整理番号：22P0351937

ポチウイルス遺伝的多様性の成形における内因性障害の寄与の解析【JST・京大機械翻訳】

Analysis of the contribution of intrinsic disorder in shaping potyvirus genetic diversity

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発行年： 2022年05月13日プレプリントサーバーでの情報更新日： 2022年05月13日
JST資料番号： O7001B 資料種別：プレプリント
記事区分：プレプリント発行国：アメリカ合衆国 (USA) 言語：英語 (EN)

内因性無秩序領域(IDRs)はRNAウイルスのプロテオームに豊富である。これらの領域の多機能特性は広く実証され,それらの構造的柔軟性はアミノ酸位置における低い制約と関連する。したがって,進化的立木点から,これらの領域は,高度に構造化された領域(規則化領域に対するORs)よりもより大きな変異許容性を持つ可能性がある。したがって,それらは潜在的適応貯留層を提供することができた。この仮説に取り組むために,植物ウイルスの主要属であるカリウイルスのゲノムにおけるIDRsとORの突然変異ロバスト性を比較した。この目的のために,シミュレーションモデル(DOI:10.5281/10d.6396239)を構築し,ランダムに生成された突然変異から生物学的データセットにおける可能な選択現象を区別するために使用した。いくつかの短期実験進化データセットを解析した。長期進化を反映するカリウイルスの3つの異なる種の自然多様性について分析も行った。IDRsの突然変異ロバスト性はORsのそれより有意に高いことを観察した。さらに,ORsの置換はアミノ酸の物理化学的特性の保存によって非常に制約される。この特徴は,置換がよりランダムである傾向があるIDRsでは見られなかった。これは,アミノ酸多型が進化の過程で自然に保存されるこれらの領域における弱い構造的制約を反映し,カリウイルスIDRsとODRは変異ロバスト性に関して異なる進化経路に従う。これらの結果は,選択時に,適応解がIDRsにより運ばれるアミノ酸多型から出現するという仮説を考察する。【JST・京大機械翻訳】

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ウイルスの生化学

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