抄録/ポイント：
抄録/ポイント
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家畜のウイルスは,ヒトとの宿主の密接な接触と動物貿易による潜在的長距離輸送により公衆衛生への大きなリスクを示す。ここでは,潜在的人畜共通病原体の流行を予測し,重要な疫学的パラメータの推定を提供するために,空間的に明示的な系統地理学的および系統力学的アプローチを用いる方法を示した。第1に,著者らは,中国における再出現ブタ疾患の原因となる病原体としてGetahウイルス(GETV)を同定するために,メタゲノム次世代シークエンシング(mNGS)を使用した。GETV分離株はヒト細胞を含む多様な細胞株で複製でき,マウスモデルにおいて高い病原性を示し,潜在的公衆衛生リスクを示唆する。家畜,ペットおよび蚊間の大規模監視により,2017年から2021年に中国内で集めたウイルス株から16の完全ゲノムおよび78のE2遺伝子配列を得た。さらに,系統発生分析は,3つの主要なGETV系統が中国の家畜における現在の流行の原因であることを明らかにした。ウイルスの伝達性と病原性に影響する可能性のあるE2における3つの潜在的ポジティブ選択部位と興味の突然変異を同定した。次に,ウイルスの進化と分散の歴史を再構築し,ウイルス系統の分散動態と時間を通してウイルス遺伝的多様性に対するいくつかの環境因子の影響を試験した。注目すべきことに,著者らは,時間を通してウイルス遺伝的多様性の主要予測因子として家畜肉消費の時間的変化を同定した。最後に,系統地理学的分析は,GETVが比較的高い平均年間温度とブタ個体群密度に関連した地域内で優先的に循環することを示した。著者らの結果は,比較的高い温度に関連した中国南部地域における家畜間のGETVの連続監視の重要性と家畜農場における蚊の管理の必要性を強調する。また,GETVの解析は,中国における新興アルボウイルスの分子疫学と早期警戒の将来の研究のベースラインを提供する。【JST・京大機械翻訳】
