抄録/ポイント：
抄録/ポイント
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種ゲノムワイドヌクレオチド多様性の変化の決定因子は,歴史的,環境的および確率的側面を含む。この多様性は,過去と現在の進化動態を知らせる。寄生虫において,伝達の様式と宿主との相互作用は,寄生虫ゲノム多様性の形成におけるこれらの側面の影響に取って代わる可能性がある。著者らは,現在のゲノム多様性および進化過程,特に系統地理学,共系統学(宿主による),自然選択および伝達モードの役割を調査するために,ミクロ胞子虫Ordospora colligataの10の個体群からゲノムサンプルを使用した。非常に密接に関連したミクロ胞子虫は,ヒトに病気を引き起こすが,O.coligataは淡水甲殻類Daphnia magnaに特異的であり,最も小さい真核生物ゲノムの1つである。著者らは,O.coligataとその宿主の間の重複する系統地理を見出し,それらの間の長期,密接な関連性を強調した。観察された地理的分布は,O.coligataが寒冷な生息地に順応するという以前の知見を反映しており,それは,より温暖な地域で主に見出されるD.magnaの他の微胞子虫腸寄生虫と区別する。co-phylogeographyは,O.coligata系統発生を較正し,その突然変異率を推定することができた。著者らは,同じ宿主を共有する他のミクロ胞子体と比較して,O.colligataにおけるより効率的な精製選択のパターンを見出し,この寄生虫が,その非常にコンパクトなゲノムを維持するのを可能にした。また,リボソーム蛋白質L24,ロイシル-tRNAシンテターゼおよび推定ABC様脂質輸送蛋白質を含む共進化に関連した潜在的選択下の領域を同定した。著者らの全ゲノム研究は,最も減少した真核生物ゲノムの1つの進化への洞察を提供し,異なる過程が偏性寄生虫のゲノム多様性をどのように形作るかを示す。Author要約Microsporidiaは,脊椎動物,無脊椎動物および単細胞生物に感染する細胞内寄生虫である。生活史とゲノミクスの多くの側面における高い変化のために,ミクロ胞子は細胞内寄生に関連した進化過程を理解するためのモデルクレードになった。しかし,マイクロ胞子における極端なゲノム構造の進化とそれらの宿主との共進化は,特にヒト疾患におけるそれらの役割を考えると,まだ調査されていない。ここでは,最も小さい既知真核生物ゲノムであるO.coligataの1つを有するミクロ胞子虫種における過去および現在の進化動力学を研究した。O.coligataの近縁は,ヒトおよび農業的に重要な動物における死亡および病気を引き起こす。著者らは,精製選択が,その減少,コンパクトゲノムの維持を助け,ミクロ胞子における異なるゲノムサイズの進化に関する仮説を裏付けていることを示す。重要なことに,寄生虫突然変異率を推定するために,その宿主の高度に分解された系統発生を利用した。この方法論は,系統発生的に関連する非寄生性真菌に対して推定した突然変異率の範囲内にある推定であるミクロ胞子に対する最初の突然変異率推定の確立を可能にした。本研究は,種生物学,生態学,およびゲノム多様性に関する複合知識が,特に系統ゲノム情報が宿主と寄生虫の両方に対してもたらすことができるとき,その進化動態を解決するのを助ける。【JST・京大機械翻訳】
