NOMe-HiC:同一DNA分子における遺伝的変異,DNAメチル化,クロマチンアクセシビリティ,および3Dゲノムの共同プロファイリング【JST・京大機械翻訳】

Fu, H.; Zheng, H.; Chen, X.; Weirauch, M. T.; Muglia, L. J.; Wang, L.; Liu, Y.

プレプリント

J-GLOBAL ID：202202218789242143 整理番号：22P0325908

NOMe-HiC:同一DNA分子における遺伝的変異,DNAメチル化,クロマチンアクセシビリティ,および3Dゲノムの共同プロファイリング【JST・京大機械翻訳】

NOMe-HiC: joint profiling of genetic variants, DNA methylation, chromatin accessibility, and 3D genome in the same DNA molecule

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発行年： 2023年02月28日プレプリントサーバーでの情報更新日： 2023年02月28日
JST資料番号： O7001B 資料種別：プレプリント
記事区分：プレプリント発行国：アメリカ合衆国 (USA) 言語：英語 (EN)

シス調節要素は,それらの標的遺伝子発現の調節を調整する。しかし,シス調節エレメントの活性と空間近接性におけるそれらの相互作用の測定は,現在の配列決定アプローチによって制限される。単一ヌクレオチド多型,DNAメチル化,クロマチン接近性(GpCメチルトランスフェラーゼフットプリント)を同時に捕捉するNOMe-HiCと,単一アッセイにおけるトランスクリプトームと共に,同じDNA分子からの染色体立体配座変化を同時に捉える方法について述べた。NOMe-HiCは,異なる分子測定にわたって最先端のモノ-オミックアッセイと高い一致を示し,空間的近接性における遠位ゲノムセグメントでの協調クロマチン接近性と,長範囲対立遺伝子特異的クロマチンアクセシビリティの新規なタイプを明らかにした。【JST・京大機械翻訳】

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, , 【Automatic Indexing@JST】

遺伝子の構造と化学 , 遺伝子発現

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