非コードRNA合成遺伝子ネットワークの全ゲノム解析は酵母における広範な可塑性とユニークな表現型を明らかにする【JST・京大機械翻訳】

Fraczek, M.; Timouma, S.; Balarezo-Cisneros, L. N.; Parker, S.; Duangrattanalert, K.; Feng, M. W.; Griffiths-Jones, S.; O'Keefe, R.; Delneri, D.

プレプリント

J-GLOBAL ID：202202218972850543 整理番号：22P0317704

非コードRNA合成遺伝子ネットワークの全ゲノム解析は酵母における広範な可塑性とユニークな表現型を明らかにする【JST・京大機械翻訳】

Genome-wide analysis of the non-coding RNA synthetic genetic network reveals extensive plasticity and unique phenotypes in yeast

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発行年： 2022年03月24日プレプリントサーバーでの情報更新日： 2022年03月24日
JST資料番号： O7001B 資料種別：プレプリント
記事区分：プレプリント発行国：アメリカ合衆国 (USA) 言語：英語 (EN)

最近の研究は,酵母における主要な適応変化に関与する未知の機能を持つ非コードRNA(ncRNA)を同定した。ncRNA相互作用を理解し,それらの機能的帰属を助けるために,合成遺伝子アレイ(SGA)方法論を用いて,>15000の二重変異体を作成し,異なる環境におけるエピスタシスをスコア化した。蛋白質ネットワークとは異なり,ncRNAは,大部分が豊富な培地で陽性エピスタシスを示した。興味深いことに,負の相互作用はストレッサー下で有意に増加し,ncRNAに対する環境依存性機能を示した。ncRNAのネットワークと隣接遺伝子のそれとの間の相関は見出されず,機能的独立性を示唆した。U3パラログ,SNR17AおよびSNR17Bは,予想されたように豊富な培地における大部分の遺伝的相互作用を共有する。例えば,SUT480はパラログと相互作用し,その機能は18S rRNA処理にリンクした。しかし,ストレッサーの下では,多数のユニークなエピスタシス相互作用が観察され,SNR17AとSNR17Bがゲノム重複後に分岐し,サブ官能化されているという考えを支持した。【JST・京大機械翻訳】

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, , , , , , , 【Automatic Indexing@JST】

分子遺伝学一般 , 微生物の生化学 , 分子・遺伝情報処理

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