文脈依存性エンハンサー機能が明らかにしたインターテール再配置【JST・京大機械翻訳】

Bolt, C. C.; Lopez-Delisle, L.; Hintermann, A.; Mascrez, B.; Rauseo, A.; Andrey, G.; Duboule, D.

プレプリント

J-GLOBAL ID：202202219033218652 整理番号：22P0312771

文脈依存性エンハンサー機能が明らかにしたインターテール再配置【JST・京大機械翻訳】

CONTEXT-DEPENDENT ENHANCER FUNCTION REVEALED BYTARGETED INTER-TAD RELOCATION

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発行年： 2022年02月02日プレプリントサーバーでの情報更新日： 2022年02月02日
JST資料番号： O7001B 資料種別：プレプリント
記事区分：プレプリント発行国：アメリカ合衆国 (USA) 言語：英語 (EN)

発生の間の重要な機能を有する遺伝子の発現は,複数のエンハンサー要素を含む大きな調節景観によって頻繁に制御される。これらの景観はしばしばトポロジー会合ドメイン(TADs)にマッチし,時には類似のエンハンサーの範囲を統合し,従って全体的調節特異性を持つTADをもたらす。エンハンサー配列対調節ドメインの相対的機能的重要性を評価するために,それらの天然ドメインから1つの特異的エンハンサー配列を,密接に関連するが,異なる機能的特異性を持つTADへ移行させるようにセットした。1つのTADに位置するエンハンサーにより近位肢細胞で最初に活性化されるので,Hoxd遺伝子とそれらの二相性調節をパラダイムとして用い,その後,隣接するTADが遠位肢細胞においてエンハンサーを活性化し始める時,その後サイレンシングした。強い遠位肢エンハンサーを近位肢TADに導入し,その新しい状況が,通常この活性に関与するHOX13転写因子により結合され続けるにもかかわらず,その遠位特異性を強く抑制することを見出した。局所遺伝的変化およびクロマチン立体配座測定を用い,エンハンサーが標的遺伝子と相互作用でき,エンハンサーのその採用近傍に匹敵するパターンを有することを見出した。周辺環境の大きな部分が除去されるときのみ,遠位肢細胞におけるその活性は救出される。これらの結果は,少なくともいくつかの場合において,エンハンサー要素の機能が局所クロマチン状況に従属し,その活性に対して支配的な制御を発揮できることを示した。【JST・京大機械翻訳】

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, , , , 【Automatic Indexing@JST】

遺伝子発現 , 遺伝子の構造と化学

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