αFold2とRoseTTAFoldは翻訳後修飾を予測する  GFP様蛋白質における発色団形成【JST・京大機械翻訳】

Hartley, S. M.; Tiernan, K. A.; Ahmetaj, G.; Cretu, A.; Zhuang, Y.; Zimmer, M.

プレプリント

J-GLOBAL ID：202202219220293218 整理番号：22P0313975

αFold2とRoseTTAFoldは翻訳後修飾を予測する GFP様蛋白質における発色団形成【JST・京大機械翻訳】

AlphaFold2 and RoseTTAFold Predict Posttranslational modifications. Chromophore Formation in GFP-like Proteins.

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発行年： 2022年02月02日プレプリントサーバーでの情報更新日： 2022年02月02日
JST資料番号： O7001B 資料種別：プレプリント
記事区分：プレプリント発行国：アメリカ合衆国 (USA) 言語：英語 (EN)

αFold2とRoseTTA折畳みは,GFP様蛋白質が発色団を翻訳後形成させるかどうかのみに基づいて予測することができる。それらの訓練は,蛋白質構造と折畳みだけでなく,化学を教えている。発色団を翻訳し,発色団を形成するのに必要な残基を持たない23GFP様非蛍光蛋白質であるGFP様蛍光蛋白質の21配列の構造を,αFold2とRosetTA折畳みにより決定した。得られた構造を,発色団形成に重要な一連の幾何学的測定に対して採掘した。これらの測定の統計解析は,両プログラムが発色団形成と非発色団形成蛋白質の間で決定的に識別することを示した。発色団を形成することができる配列と発色団形成に必要な残基を持たない配列間の明確な区別は,S65T GFPの結晶構造の中心αヘリックスの重なりのRMSDとαFold2決定構造である単一測定を調べることにより得ることができる。【JST・京大機械翻訳】

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分子構造

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