B型肝炎ウイルスカプシド集合のマルチスケールモデリングとその二形性【JST・京大機械翻訳】

Mohajerani, F.; Tyukodi, B.; Schlicksup, C. J.; Hadden-Perilla, J. A.; Zlotnick, A.; Hagan, M. F.

プレプリント

J-GLOBAL ID：202202219370630166 整理番号：22P0316216

B型肝炎ウイルスカプシド集合のマルチスケールモデリングとその二形性【JST・京大機械翻訳】

Multiscale Modeling of Hepatitis B Virus Capsid Assembly and its Dimorphism

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発行年： 2022年02月23日プレプリントサーバーでの情報更新日： 2022年02月23日
JST資料番号： O7001B 資料種別：プレプリント
記事区分：プレプリント発行国：アメリカ合衆国 (USA) 言語：英語 (EN)

B型肝炎ウイルス(HBV)は,年間80万人の死亡をもたらす風土病,慢性ウイルスである。HBVライフサイクルの中心から,ウイルスコアは単一蛋白質の多くのコピーから集合した蛋白質カプシドを持つ。カプシド蛋白質は異なる(準等価)立体配座を採用し,Caspar-Klug命名においてそれぞれ180または240蛋白質,T=3またはT=4を含む二十面体カプシドを形成した。HBVカプシド集合は,新しい抗ウイルス薬のための重要な標的になった。HBV二形性を制御する集合経路と機構は不明である。完全なHBVカプシドの全ての原子分子動力学シミュレーションから学習されたパラメータを持つ粗粒モデルを用い,HBV集合の計算機シミュレーションを記述し,計算的に扱いやすい。得られたモデルによる動的シミュレーションはHBV集合経路と生成物の実験的観察を再現する。Markov状態モデルを構築して,遷移経路理論を採用して,T=3,T=4,および他の実験的に観察されたカプシド形態に至る経路を同定した。分析は,この多型を制御する因子,特にカプシド蛋白質の立体配座自由エネルギー景観とそれらの相互作用を同定した。【JST・京大機械翻訳】

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ウイルスの生化学 , 蛋白質・ペプチド一般

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