組織特異的必須遺伝子の遺伝的機構【JST・京大機械翻訳】

Dvir, E.; Shohat, S.; Shifman, S.

プレプリント

J-GLOBAL ID：202202219378761499 整理番号：21P0250801

組織特異的必須遺伝子の遺伝的機構【JST・京大機械翻訳】

Genetic mechanisms for tissue-specific essential genes

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発行年： 2022年01月25日プレプリントサーバーでの情報更新日： 2022年01月25日
JST資料番号： O7001B 資料種別：プレプリント
記事区分：プレプリント発行国：アメリカ合衆国 (USA) 言語：英語 (EN)

遺伝的疾患は,すべての細胞において遺伝的リスク変異体を持つにもかかわらず,特定の組織でしばしば現れる。最も一般的に仮定された機構は,病原性組織における原因遺伝子の選択的発現であるが,他のメカニズムはあまり研究されていない。789の細胞株と27の系統からCRISPRスクリーンを用いて,1274の系統特異的必須遺伝子(LSEG)を同定した。LSEGの少数のみが選択的発現(n=115)により説明され,それらの大きな割合(n=509)が系統特異的遺伝子増幅により説明されることを示した。ゲノムワイド発現解析により3つの他の機構を同定した。第1に,パラログの系統特異的発現は機能的冗長性の低下をもたらし,153LSEGsを説明する。第2に,45のLSEGに対して,パラログ発現は脆弱性を増加させ,機能的共依存性を意味する。第3に,小分子の変異体細胞への移動は血液特異的必須性を説明できることを示唆した。全体として,LSEGは,一般的な必須遺伝子よりもヒト疾患と関連する可能性が高く,発生経路における変異および機能に高度に不耐性であった。多様なヒト細胞型の解析は,LSEGとそれらのパラログの発現特異性が一般的な現象である優先的発現と機能的冗長性と一致することを見出した。著者らの知見は,ヒト疾患の組織特異性に対する遺伝的メカニズムに重要な洞察を提供する。【JST・京大機械翻訳】

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, , , , , 【Automatic Indexing@JST】

遺伝子の構造と化学 , 遺伝子発現 , 進化論一般

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