スーパーコイル感受性遺伝子とは何か?グラム陰性細菌Dickeya dadantiiにおけるトポイソメラーゼI阻害からの洞察【JST・京大機械翻訳】

Pineau, M.; Martis B., S.; Forquet, R.; Baude, J.; Villard, C.; Grand, L.; Popowycz, F.; Soulere, L.; Hommais, F.; Nasser, W.; Reverchon, S.; Meyer, S.

プレプリント

J-GLOBAL ID：202202219447943952 整理番号：21P0250829

スーパーコイル感受性遺伝子とは何か?グラム陰性細菌Dickeya dadantiiにおけるトポイソメラーゼI阻害からの洞察【JST・京大機械翻訳】

What is a supercoiling-sensitive gene? Insights from topoisomerase I inhibition in the Gram-negative bacterium Dickeya dadantii

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発行年： 2022年03月21日プレプリントサーバーでの情報更新日： 2022年03月21日
JST資料番号： O7001B 資料種別：プレプリント
記事区分：プレプリント発行国：アメリカ合衆国 (USA) 言語：英語 (EN)

DNAスーパーコイル化は細菌染色体圧縮の必須機構であり,そのレベルはトポイソメラーゼIとDNAギラーゼにより主に調節される。これらの酵素のいずれかを抗生物質で阻害すると,全体的スーパーコイル化修飾とその後の全体的遺伝子発現の変化が生じる。以前の研究で,ギラーゼ阻害により誘導されたDNA弛緩に応答する遺伝子は「スーパーコイル感受性」として分類された。ここでは,非市販抗生物質セコネオールシンを用いて,植物病原体Dickeya dadantiiにおけるDNAスーパーコイル化の逆変異を研究した。薬物は,この種からトポイソメラーゼIに対して活性であり,トポイソメラーゼI阻害に対するグラム陰性菌の最初のトランスクリプトーム応答を分析した。応答遺伝子はDNA緩和後に観察されたものと本質的に異なり,さらに増殖期に依存することを見出した。これらの遺伝子を機能レベルで特性化し,また,染色体に沿った発現レベル,空間および配向組織に関して明確なパターンを検出した。まとめると,これらの結果は,スーパーコイル感受性が複雑な特徴であり,それは生理学的条件,およびそれらのゲノム状況における特異的トポイソメラーゼの作用に依存することを明らかにした。いくつかのプロモーターの以前のin vitro発現データに基づいて,ギラーゼまたはトポイソメラーゼI阻害後に観察される多くの対照的なトランスクリプトーム特徴を説明するSC依存性調節の定性的モデルを提案した。【JST・京大機械翻訳】

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酵素一般 , 遺伝子発現 , 細菌による植物病害

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