進化計算からの人工選択法は微生物の指向性進化の有望性を示す【JST・京大機械翻訳】

Lalejini, A.; Dolson, E.; Vostinar, A. E.; Zaman, L.

プレプリント

J-GLOBAL ID：202202219823451373 整理番号：22P0326288

進化計算からの人工選択法は微生物の指向性進化の有望性を示す【JST・京大機械翻訳】

Artificial selection methods from evolutionary computing show promise for directed evolution of microbes

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発行年： 2022年04月21日プレプリントサーバーでの情報更新日： 2022年04月21日
JST資料番号： O7001B 資料種別：プレプリント
記事区分：プレプリント発行国：アメリカ合衆国 (USA) 言語：英語 (EN)

直接的微生物進化は,実験室における進化過程を利用して,強化または新規機能形質を有する微生物を構築した。応用目標のための直接進化プロセスへの試みは,進化的計算に基本的であり,それは,困難な計算問題に対する解決のための一般的目的探索エンジンとしてDarwinian進化の原理を利用する。それらの重複アプローチにもかかわらず,進化的コンピューティングからの人工選択法は,実験室における生体系に対して一般的に適用されていない。本研究では,進化的計算から有望な前駆細胞を選択するための親選択アルゴリズム-プロセージが,複数の機能的形質を選択するとき,微生物個体群の進化を指示するのに有用であるかどうかを知っている。そうするために,著者らは,進化計算(トーナメント選択,レキシカーゼ選択,および非支配エリート選択)から,実験室(エリートとトップ-10%選択)で通常用いられる方法と比較して,よく3つの選択アルゴリズムを評価するために使用した,有向微生物進化のエージェントベースモデルを紹介する。進化計算(レキシカーゼと非支配エリート)からの多目的選択技法は,関心の複数の形質を選択するとき,通常使用される有向進化手法よりも一般的に優れていることを見出した。これらの結果は,これらの多目的選択手順を実験室に移転する進行中の研究を動機づけた。さらに,著者らの知見は,進化計算からのより洗練された人工選択法が,有向微生物進化で使用するために評価されるべきであることを示唆する。【JST・京大機械翻訳】

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, , , , , , 【Automatic Indexing@JST】

進化論一般 , システム最適化手法

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