DNA Plectonemesの平衡ゆらぎ【JST・京大機械翻訳】

Skoruppa Enrico; Carlon Enrico

プレプリント

J-GLOBAL ID：202202219902389470 整理番号：22P0350822

DNA Plectonemesの平衡ゆらぎ【JST・京大機械翻訳】

Equilibrium Fluctuations of DNA Plectonemes

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発行年： 2022年05月16日プレプリントサーバーでの情報更新日： 2022年05月16日
JST資料番号： O7000B 資料種別：プレプリント
記事区分：プレプリント発行国：アメリカ合衆国 (USA) 言語：英語 (EN)

※このプレプリント論文は学術誌に掲載済みです。なお、学術誌掲載の際には一部内容が変更されている可能性があります。

プレクトンームは,DNA分子がスーパーコイル化されたときに形成される,すなわち,過剰または過小に形成される,絡み合ったらせん状ループドメインである。それらは細胞DNAに遍在し,それらの物理的性質は実験的およびモデリング側の両方から大きな興味を引いている。本研究では,外部伸縮力を受けるスーパーコイル線形DNA分子のエンドポイント距離zの変動を調べた。本解析は,伸長したおよびプレクトンミック相から成るスーパーコイルDNAを記述する2相モデルに基づいている。いくつかの異なる機構が,拡張変動によって特性化される拡張変動に寄与することが分かった。相交換変動,過渡収縮及びプレクトンの膨張に起因する分散への支配的寄与を見出し,それは2相間の分子長の交換を伴った。Twistable Wormlikeチェーンのモンテカルロシミュレーションを行い,種々の量の変動を解析し,2相モデル予測と一致することを見出した。さらに,高力での拡張とその分散は,2相モデルによって非常に良く捕捉され,1つは二次近似を越えていることを示した。【JST・京大機械翻訳】

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核酸一般

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