RNA二次構造をモデル化するための非帰属NMR化学シフトの利用【JST・京大機械翻訳】

Moudgal, N.; Arhin, G.; Frank, A. T.

プレプリント

J-GLOBAL ID：202202220073164367 整理番号：22P0313842

RNA二次構造をモデル化するための非帰属NMR化学シフトの利用【JST・京大機械翻訳】

Using Unassigned NMR Chemical Shifts to Model RNA Secondary Structure

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発行年： 2022年02月02日プレプリントサーバーでの情報更新日： 2022年02月02日
JST資料番号： O7001B 資料種別：プレプリント
記事区分：プレプリント発行国：アメリカ合衆国 (USA) 言語：英語 (EN)

NMR由来化学シフトはRNA構造の高感度プローブである。しかし,NMRスペクトルを割り当てる必要性は構造情報の直接源としての有用性を妨げる。本報告では,RNAの二次構造をモデル化するために,非帰属2D NMRスペクトルを用いる簡単な方法について述べた。帰属された化学シフトと同様に,著者らは,最高の加重構造がそれらの参照NMR構造に密接に似ているように,立体配座ライブラリーを再重み付けするための非帰属化学シフトデータを使用することができた。さらに,SARS-CoV-2ゲノムの3-および5-UTRへの著者らのアプローチの応用は,化学プロービングデータから得られた二次構造モデルと一致する,ほとんどの部分に対する構造をもたらした。したがって,ここで述べるフレームワークは,非帰属2D NMRスペクトルから直接予備的構造RNAモデルを迅速に生成するための一般的戦略として有用であろうと期待する。SARS-CoV-2の337-ntおよび472-nt UTRsについて示すように,著者らのアプローチは,大きなRNAの二次構造のモデル化に特に有用である。【JST・京大機械翻訳】

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, , , , 【Automatic Indexing@JST】

分子構造 , 有機化合物のNMR

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