Symbiodiniaceae藻類ゲノムにおけるウイルス侵入の多重波【JST・京大機械翻訳】

Benites, L. F. d. A.; Stephens, T. G.; Bhattacharya, D.

プレプリント

J-GLOBAL ID：202202220172115025 整理番号：22P0334389

Symbiodiniaceae藻類ゲノムにおけるウイルス侵入の多重波【JST・京大機械翻訳】

Multiple waves of viral invasions in Symbiodiniaceae algal genomes

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発行年： 2022年04月13日プレプリントサーバーでの情報更新日： 2022年04月13日
JST資料番号： O7001B 資料種別：プレプリント
記事区分：プレプリント発行国：アメリカ合衆国 (USA) 言語：英語 (EN)

科Symbiodiniaceaeからのジノフラゲラートは,多様な宿主と共生する光合成海洋原生生物である。それらの大規模で明確なゲノムは,広範な遺伝子重複と大規模な逆位イベントを示す。しかし,この藻類ファミリーのゲノム進化における水平遺伝子導入(HGT)の役割とスケールについてはほとんど知られていない。他の渦鞭毛藻類では,大きなDNA藻類ウイルスからHGTを介して発生するウイルス獲得核蛋白質の出現のような主要なゲノム遷移にリンクして,高レベルのHGTが観察された。以前の研究は,異なる宿主由来のSymbiodiniaceaeが,巨大DNAウイルスやssRNAウイルスなどのいくつかのウイルスグループによって活発に感染し,サンゴの健康に重要な役割を果たす可能性があることを示している。これは,ウイルスが細胞質に持続し,プロウイルスとして宿主ゲノムに統合できる仮想的な潜在ウイルス感染を含む。しかし,この仮説は,いくつかの実験的支持を受けたが,推定潜在ウイルスの細胞局在とそれらの分類的親和性はまだ知られていない。加えて,Symbiodiniaceaeのいくつかのゲノムにおけるウイルス配列の発見にもかかわらず,ウイルス起源,分類学的幅,および代謝可能性は調査されていない。これらの疑問に取り組むため,13Symbiodiniaceaeゲノムにおける推定ウイルス起源の蛋白質配列の証拠を探索した。著者らは,59の候補ウイルス由来HGTsを見出し,10のゲノムにわたって12の系統性を生じた。また,これらのウイルス関連配列,それらの構造,およびゲノム状況の分類的関係を述べた。これらの結果から,Symbiodiniaceaeウイルス獲得の起源と運命を説明するモデルを提案した。【JST・京大機械翻訳】

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ウイルスの形態学,分類学

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