Escherichia coli細胞質における拡散の蛋白質サイズ,環境条件および細胞増殖への依存性【JST・京大機械翻訳】

Bellotto, N.; Agudo-Canalejo, J.; Colin, R.; Golestanian, R.; Malengo, G.; Sourjik, V.

プレプリント

J-GLOBAL ID：202202220402212408 整理番号：22P0315648

Escherichia coli細胞質における拡散の蛋白質サイズ,環境条件および細胞増殖への依存性【JST・京大機械翻訳】

Dependence of diffusion in Escherichia coli cytoplasm on protein size, environmental conditions and cell growth

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発行年： 2022年08月31日プレプリントサーバーでの情報更新日： 2022年08月31日
JST資料番号： O7001B 資料種別：プレプリント
記事区分：プレプリント発行国：アメリカ合衆国 (USA) 言語：英語 (EN)

原核生物細胞に加えて,受動的翻訳拡散は,細胞質蛋白質がそれらの位置に達することができる速度を制限する。従って,拡散は,ほとんどの細胞過程に基本的であるが,細菌細胞の高密集および非均一環境における蛋白質移動度の理解はまだ限られている。ここでは,大腸菌の細胞質における蛋白質の大きな集合の移動度を,シミュレーションと理論的モデリングと組み合わせた蛍光相関分光法(FCS)を用いて調べた。細胞質蛋白質移動度は,細菌細胞の限定された形状におけるBrown拡散および高分子密集により課された高粘度で良く記述できると結論した。蛋白質拡散の類似したサイズ依存性を,E.coliに対する天然または外来性,およびより速い拡散蛋白質に対して,蛋白質融合の特異的ダンベル形状を考慮した場合,Stokes-Einstein関係と良く整合した。顕著なサブ拡散と妨害された移動性は,細胞質内の広範な相互作用を持つ蛋白質でのみ観察された。最後に,蛋白質拡散は,活発に増殖する細胞で,高温,またはリファンピシンによる処理で著しく速くなり,高浸透圧で遅くなると,これら全ての摂動は,同じ割合で異なるサイズの蛋白質に影響し,これにより,良く定義された細胞質粘度の変化として記述できる。【JST・京大機械翻訳】

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蛋白質・ペプチド一般 , 分子構造

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