エボラウイルス感染中のlncRNAのin vivo単一細胞プロファイリング【JST・京大機械翻訳】

Santus, L.; Garcia-Perez, R.; Sopena-Rios, M.; Lin, A. E.; Adams, G. C.; Barnes, K. G.; Siddle, K. J.; Wohl, S.; Reverter, F.; Rinn, J. L.; Bennett, R. S.; Hensley, L. E.; Sabeti, P. C.; Mele, M.

プレプリント

J-GLOBAL ID：202202220475511730 整理番号：22P0032388

エボラウイルス感染中のlncRNAのin vivo単一細胞プロファイリング【JST・京大機械翻訳】

In vivo single-cell profiling of lncRNAs during Ebola virus infection

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発行年： 2022年01月13日プレプリントサーバーでの情報更新日： 2022年01月13日
JST資料番号： O7001B 資料種別：プレプリント
記事区分：プレプリント発行国：アメリカ合衆国 (USA) 言語：英語 (EN)

長い非コードRNA(lncRNAs)はウイルス感染に対する全身免疫応答の重要なメディエーターであるが,免疫刺激に関するそれらの発現および機能に関するほとんどの研究はin vitroバルク細胞集団に限定される。これは,lncRNA発現が単一細胞解像度でどのように変化するかの理解を強く制限し,それらの細胞型特異的免疫調節役割が蛋白質コード遺伝子と比較して異なる可能性がある。ここでは,in vivoでのエボラウイルス(EBOV)感染時の単一細胞解像度におけるlncRNA発現変異の最初の詳細な特性化を行った。119の試料と12の組織型からのバルクRNA配列を用いて,現在のマカクのlncRNAアノテーションを有意に拡大した。次に,EBOV感染時の免疫循環単一細胞におけるlncRNA発現変異をプロファイルし,より少ない細胞でのlncRNA発現がそれらの蛋白質コード遺伝子対応物からの主要な分化因子であることを見出した。EBOV感染により,lncRNAは,EBOVにより標的化される主要な細胞型,特に単球において,それらの発現プロファイルにおいて動的および大部分が細胞型特異的変化を示す。このような変化はインターフェロン応答やプリン代謝などの重要な先天性免疫応答に関連する遺伝子調節モジュールと関連する。感染細胞内で,いくつかのlncRNAはウイルス負荷と正および負に相関し,これらlncRNAの幾つかの発現は宿主細胞を攻撃するEBOVにより直接に隠されることを示唆した。本研究は,lncRNAが急性ウイルス感染に対する宿主応答において果たす役割への新たな洞察を提供し,単一細胞解像度での将来のlncRNA研究への道を開いた。【JST・京大機械翻訳】

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遺伝子発現

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