SARS-CoV-2変異体のゲノムサーベイランスとインドにおけるCOVID-19の第2波に焦点を当てた病因におけるその役割【JST・京大機械翻訳】

Sarkar, P.; Banerjee, S.; Saha, S. A.; Mitra, P.; Sarkar, S.

プレプリント

J-GLOBAL ID：202202220508223158 整理番号：22P0319993

SARS-CoV-2変異体のゲノムサーベイランスとインドにおけるCOVID-19の第2波に焦点を当てた病因におけるその役割【JST・京大機械翻訳】

Genome surveillance of SARS-CoV-2 variants and their role in pathogenesis focusing on second wave of COVID-19 in India

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発行年： 2022年02月11日プレプリントサーバーでの情報更新日： 2022年02月11日
JST資料番号： O7002B 資料種別：プレプリント
記事区分：プレプリント発行国：アメリカ合衆国 (USA) 言語：英語 (EN)

インドは,SARS-CoV-2感染における前例のないサージとCOVID-19の第2波の間の再帰結を目撃したが,疾患の疫学的に基づく時空間発生率の詳細な報告は欠けている。ここでは,循環VoCの病因のパターンを知るため,相関,階層的クラスタリングのような各種の統計的方法を適用した。B.1.617.1(Kappa)は,第2波の初期相の間の優勢なVoCであった。Delta(B.1.617.2)またはDelta様(AY.x)VoCは,第2波のピークの間,症例の大多数(>90.17)を構成する。相関プロットは,Delta/Delta様系統がB.1.617.1(κ),B.1.1.7,B.1,B.1.36.29およびB.1.36を含む他の系統と逆相関することを示した。Delta/Delta様サージは第2波と一致したが,他の全ての系統(B.1.617.1,B.1.36.29など)は第2波の前相中に発生した。時空間分析は,ほとんどのインド州がデルタサージによる第2波のピークの間に影響を受け,同じクラスタの下で降下することを示した。インドの北東州と島によって多く存在する第2のクラスタは,ほとんど影響を受けなかった。DeltaまたはDelta様のスパイク蛋白質内のL452K,D614GおよびP681Rと共に,シグネチャ変異(T478K,D950N,E156G)の存在は,宿主細胞付着の上昇を引き起こし,伝達を増加させ,そして,時間の経過により,他の循環変異体を置換する。新しいVoCsのタイムリーな評価は,診断,医療産業によるワクチン開発,および政府,教育機関,および企業産業を含むさまざまな機関による意思決定を更新するための理論的根拠を提供するであろう。【JST・京大機械翻訳】

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ウイルスの生化学 , 感染症・寄生虫症一般

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