プレプリント
J-GLOBAL ID：202202220514863673   整理番号：22P0321543

空気,表面スワブおよび廃水中のSARS-CoV-2のゲノムフットプリントを用いたCOVID-19予測【JST・京大機械翻訳】

COVID-19 Prediction using Genomic Footprint of SARS-CoV-2 in Air, Surface Swab and Wastewater
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著者 (22件)：
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資料名：
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発行年： 2022年04月01日  プレプリントサーバーでの情報更新日： 2022年04月01日
JST資料番号： O7002B  資料種別： プレプリント
記事区分： プレプリント  発行国： アメリカ合衆国 (USA)  言語： 英語 (EN)
抄録/ポイント：
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感染個体によって排出される病原体の輸入ゲノムフットプリントは環境試料で追跡できる。これらの試料の分析は,感染症の非侵襲的サーベイランスに使用できる。【目的】大学生におけるCOVID-19症例を予測するための重症急性呼吸器症候群コロナウイルス2(SARS-CoV-2)の環境監視の有効性を評価する。前向き実験計画,空気,表面スワブ,および廃水試料を3月から5月2021日までの大学臭気から採集した。学生は,研究期間の間にCOVID-19のためにランダムにスクリーニングした。環境試料中のSARS-CoV-2を電気陰性濾過で濃縮し,Volcano2世代-qPCRを用いて定量した。環境試料中の時間遅れSARS-CoV-2と臨床的に診断されたCOVID-19症例との関連を調べるために記述分析を行った。本研究は,米国,カリフォルニア州,ミア大学における住宅のdormitにおいて実施した。約500名の学生を収容した。COVID-19を2-3日/週の間,口mitから出入し,口内へ入る間,口mitからの参加者はランダムにスクリーニングされた。主な結果:主にCOVID-19症例は,著者らの主な興味であった。環境試料中のSARS-CoV-2検出は,dormitoryにおける局所COVID-19症例の存在の指標であり,SARS-CoV-2は,COVID-19症例の臨床診断の前に数日間環境サンプルで検出できると仮定した。【結果】SARS-CoV-2ゲノムフットプリントを,研究期間の間,それぞれ52(63.4%),40(50.0%)および57(68.6%)日に,空気,表面スワブおよび廃水サンプルにおいて検出した。78日のSARS-CoV-2の19(24%)は,すべての3つのサンプルタイプで検出された。臨床的に診断されたCOVID-19症例を,研究期間中に11日間報告し,SARS-CoV-2も,空気,表面スワブおよび廃水サンプルで,それぞれ11(100%),9(81.8%)および8(72.7%)日に,症例診断の2日前に検出した。【結語】コミュニティ/公共環境におけるSARS-CoV-2または他の病原体の活発な環境監視は,感染症発生を含むおよび/または軽減するための標的対策を導く可能性を有する。キーポイントO_ST_ABSQustionC_ST_ABSHow有効は,コミュニティにおけるCOVID-19ケースの早期検出のための公共場所におけるSARS-CoV-2の環境監視である。結論:臨床的に確認されたCOVID-19症例を,大学生における環境試料中の2日遅延SARS-CoV-2の助けで予測した。しかし,予測効率は試料タイプによって変化した:空気サンプルによる最良の予測,続いて廃水と表面スワブ試料。SARS-CoV-2は,COVID-19の報告された症例なしでも,これらのサンプルで検出され,COVID-19症例の過小報告を示唆した。平均SARS-CoV-2は,COVID-19症例の臨床報告の数日前に環境サンプルで検出できる。したがって,公共場所におけるミクロビオームの積極的な環境監視は,感染症の場所-時間特異的発生の早期発見のための平均として役立つ。それは感染症の過小報告にも使用できる。【JST・京大機械翻訳】
シソーラス用語：
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感染症・寄生虫症一般 
(GD01010H)

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