藻類分泌ゲノムのマッピング:Chlamydomonas reinhardtiiのための小RNA遺伝子座地図【JST・京大機械翻訳】

Mueller, S. Y.; Matthews, N. E.; Valli, A. A.; Baulcombe, D.

プレプリント

J-GLOBAL ID：202202220546616422 整理番号：22P0238681

藻類分泌ゲノムのマッピング:Chlamydomonas reinhardtiiのための小RNA遺伝子座地図【JST・京大機械翻訳】

Mapping the Algal Secret Genome: The small RNA Locus Map for Chlamydomonas reinhardtii

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発行年： 2020年06月16日プレプリントサーバーでの情報更新日： 2020年06月16日
JST資料番号： O7001B 資料種別：プレプリント
記事区分：プレプリント発行国：アメリカ合衆国 (USA) 言語：英語 (EN)

低分子(s)RNAは,エピジェネティック修飾,転写後遺伝子サイレンシング,および内因性および外因性ウイルスの両方に対する防御を指示する真核生物における遺伝子発現およびゲノム安定性の調節において決定的役割を果たす。緑藻類Chlamydomonas reinhardtiiは,陸生植物とは異なるsRNAベースの機構を有するよく研究された単細胞藻類種である。したがって,sRNA進化を研究するための良いモデルがあるが,sRNA機構の系統的分類は,これおよび他の藻類において欠けている。ここでは,多重対応分析(MCA)とクラスタリングを含むデータ駆動機械学習アプローチを用いて,C.reinhardtiiに対する包括的注釈と分類sRNA遺伝子座マップを作成した。この地図は,より高い植物と動物でいくつかの共通特性を示すが,異なる特徴を明らかにした。これらの結果は,より高い植物系統からの藻類の進化的発散後のsRNA機構における多様化があるという考えと一致する。【JST・京大機械翻訳】

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遺伝子発現 , 分子遺伝学一般

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