TidyMass:LC-MSデータのためのオブジェクト指向再現性解析フレームワーク【JST・京大機械翻訳】

Shen, X.; Yan, H.; Wang, C.; Gao, P.; Johnson, C.; Snyder, M.

プレプリント

J-GLOBAL ID：202202220662318773 整理番号：22P0318290

TidyMass:LC-MSデータのためのオブジェクト指向再現性解析フレームワーク【JST・京大機械翻訳】

TidyMass: An Object-oriented Reproducible Analysis Framework for LC-MS Data

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発行年： 2022年03月17日プレプリントサーバーでの情報更新日： 2022年03月17日
JST資料番号： O7001B 資料種別：プレプリント
記事区分：プレプリント発行国：アメリカ合衆国 (USA) 言語：英語 (EN)

再現性と透明性は長年であるが,メタボロミクス分野にとって重大な問題である。ここでは,LC-MSに基づく非標的メタボロミクスのためのデータ処理と分析の共有可能かつ再現性のあるワークフローニーズを達成できる包括的計算フレームワークであるタイディマスプロジェクト(https://www.tidymass.org/)を提示した。Tidy Massは,現在のツールの限界に取り組むための次の戦略に基づいて設計した。1)クロスプラットフォームの有用性。Tidy Massはすべてのプラットフォームに設置できる。2)均一性,共有性,トレーサビリティ,および再現性。均一データフォーマットを開発し,処理メタボロミクスデータおよび処理パラメータを貯蔵および管理し,事前分析段階およびパラメータを追跡することを可能にした。3)柔軟性と伸展性。モジュラアーキテクチャは,非常に柔軟で拡張可能なツールであり,そのため,他のユーザは,それを改善でき,それらをそれ自身のパイプラインと容易に統合できる。【JST・京大機械翻訳】

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, , , , 【Automatic Indexing@JST】

代謝一般 , 質量分析

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