大西洋アジ(Trachurus trachurus)における局所的適応のゲノム基盤と環境相関【JST・京大機械翻訳】

Fuentes-Pardo, A. P.; Farrell, E. D.; Pettersson, M. E.; Sprehn, C. G.; Andersson, L.

プレプリント

J-GLOBAL ID：202202220668312980 整理番号：22P0339115

大西洋アジ(Trachurus trachurus)における局所的適応のゲノム基盤と環境相関【JST・京大機械翻訳】

The genomic basis and environmental correlates of local adaptation in the Atlantic horse mackerel (Trachurus trachurus)

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発行年： 2022年05月18日プレプリントサーバーでの情報更新日： 2022年05月18日
JST資料番号： O7001B 資料種別：プレプリント
記事区分：プレプリント発行国：アメリカ合衆国 (USA) 言語：英語 (EN)

地域環境に適応する個体群が気候変動による生物多様性損失を防止するためにますます重要になっている。ここでは,北海から北アフリカ,西地中海の12の大西洋ウマのサバ試料の全ゲノム変動を調べた。この海洋移動性底生魚は,東部大西洋で最も広く分布し,商業的に重要な種の一つである。中性遺伝子座で低い個体群構造を見出したが,地中海西部と北海個体群を他の大西洋地域と区別する適応遺伝子座での高い分化が見られた。地中海特有のCandida遺伝子は,青緑色光条件に対するスペクトル感受性を微調整するかもしれない2つのミスセンス突然変異を持つ緑色感受性オプシンを含む。北海のCandidate遺伝子特性は耐寒性(エネルギー代謝と細胞膜構造)で重要な役割を果たし,臭気に対する感受性を増加させ,混濁水における可視度の低下をおそらく補償した。また,著者らは,中期ポルトガルの近くで,気候関連緯度躍層に従う推定染色体反転(9.9Mb)を発見した。ゲノム-環境関連分析は,海水溶存酸素濃度と温度が局所適応の主な環境駆動因子であることを示した。ゲノムデータは現在のストック分割を広く支持するが,西部と南部のストック境界の改訂を推奨する。近隣集団から北海と北アフリカを遺伝的に識別する還元SNPパネルを開発した。本研究は,遺伝子流動による適応における生活史と染色体反転の重要性,および局所適応に関与する進化と生態学的過程の複雑性を強調する。【JST・京大機械翻訳】

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, 【Automatic Indexing@JST】

集団遺伝学 , 個体群生態学 , 魚類

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