小児における肝移植拒絶反応における動的DNAメチル化の役割【JST・京大機械翻訳】

Ningappa, M.; Shao, X.; Ashokkumar, C.; Xu, Q.; Zeevi, A.; Grundberg, E.; Pastinen, T.; Sindhi, R.

プレプリント

J-GLOBAL ID：202202220846739003 整理番号：22P0347258

小児における肝移植拒絶反応における動的DNAメチル化の役割【JST・京大機械翻訳】

The role of dynamic DNA methylation in liver transplant rejection in children

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発行年： 2022年05月05日プレプリントサーバーでの情報更新日： 2022年05月05日
JST資料番号： O7001B 資料種別：プレプリント
記事区分：プレプリント発行国：アメリカ合衆国 (USA) 言語：英語 (EN)

【背景】肝移植(LT)拒絶の処方的調節は,新規予測および治療目標を明らかにする可能性がある。【目的】LT後の生検で証明された急性細胞拒絶(拒絶剤,R)の小児における差異DNAメチル化の役割を試験する。【方法】4Rと13の非拒絶者(NR)を含む17人の子供からLTの前後で末梢血DNAサンプルを得て,免疫細胞特異的調節要素で5百万のCpGsをカバーするメチルC捕獲塩基配列決定法(MCC-Seq)法で分析した。差別的にメチル化されたCpG(DMCs)は,性別と年齢に対して調整される一般化線形回帰モデルを用いて同定され,3つ以上のDMCから成る差別的にメチル化された領域(DMR)に合併した。【結果】R vs NRを対比して,著者らは,LT後で2238のDMCsとプレLTサンプルで2620のDMCsを同定し,それぞれ216と282のDMRsにクラスタ化した。Rに関連するDMCはエンハンサーに富み,プロモーターに枯渇した。低メチル化対高メチル化DMRsの比率は,LT後DMCs前LT DMCsにおいて,それぞれ22%から48%(p<0.0001)に増加した。LT後DMCsで富化した最高ランク生物学的プロセスは,それぞれMHCクラスI,MHCクラスI複合体およびペプチド結合(p<7.92E-17)を介した抗原処理および提示であった。トップランクされたDMRは,B細胞受容体シグナル伝達(ADAM1)を仲介する遺伝子にマップされ,またはいくつかの免疫細胞(ARRB2)(p<3.75E-08)を調節する。MHCクラスI遺伝子のDMRは,TFと結合するSNP,遺伝子発現とスプライシング,またはペプチド結合アミノ酸配列の変化に富んでいた。結論:遠位調節領域における動的メチル化は,既知の移植関連MHC依存性拒絶経路を明らかにし,小児移植サブコホートにおける将来の機構的評価のための新規遺伝子座を同定する。【JST・京大機械翻訳】

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消化器疾患の外科療法

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