有利な変異体の存在におけるポピュレーションダイナミックスに対する決定論的近似【JST・京大機械翻訳】

Rodriguez-Brenes, I.; Wodarz, D.; Komarova, N.

プレプリント

J-GLOBAL ID：202202220966537307 整理番号：22P0031642

有利な変異体の存在におけるポピュレーションダイナミックスに対する決定論的近似【JST・京大機械翻訳】

Deterministic approximation for population dynamics in the presence of advantageous mutants

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発行年： 2022年01月05日プレプリントサーバーでの情報更新日： 2022年01月05日
JST資料番号： O7001B 資料種別：プレプリント
記事区分：プレプリント発行国：アメリカ合衆国 (USA) 言語：英語 (EN)

進化過程の空間確率的シミュレーションは計算的に高価である。ここでは,[1]に導入された空間的に明示的なデカップリング近似(SEDA)に基づいて,2つのタイプ,即ち,より有利なレジデントタイプとより有利な変異体の存在における空間確率的誕生死過程に対する決定論的近似を導いた。この技術のコアは2つの必須段階である。(1)隣接個体間の空間相互作用を近似するODEのシステムを解決しなければならない;(2)時間変数は野生型と変異個体の動力学的パラメータに依存する因子(””)で再スケールされる必要がある。2つのタイプの分割と死亡率のべき乗則である明示的公式を導いた。この方法は比較的速く,空間エージェントベースモデルに対する確率的シミュレーション結果と優れた時系列一致を提供した。この方法論を用いて,発癌,細菌進化および耐性動力学の側面におけるドライバー変異の拡大を含む,ハード選択的スイープ事象を記述した。【JST・京大機械翻訳】

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, , , 【Automatic Indexing@JST】

個体群生態学 , 植物生態学

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