マルチプレックスddPCRを用いた初期ヒト感染中のサブゲノム及びゲノムRNAのSARS-CoV-2転写の特性化【JST・京大機械翻訳】

Hwang, H. S.; Lo, C.-M.; Murphy, M.; Grudda, T.; Gallagher, N.; Luo, C. H.; Robinson, M. L.; Mirza, A.; Conte, M.; Conte, A.; Zhou, R.; Brooke, C. B.; Pekosz, A.; Mostafa, H. H.; Manabe, Y. C.; Thio, C. L.; Balagopal, A.

プレプリント

J-GLOBAL ID：202202221079551288 整理番号：22P0320796

マルチプレックスddPCRを用いた初期ヒト感染中のサブゲノム及びゲノムRNAのSARS-CoV-2転写の特性化【JST・京大機械翻訳】

Characterizing SARS-CoV-2 transcription of subgenomic and genomic RNAs during early human infection using multiplexed ddPCR

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資料名：
発行年： 2022年02月19日プレプリントサーバーでの情報更新日： 2022年02月19日
JST資料番号： O7002B 資料種別：プレプリント
記事区分：プレプリント発行国：アメリカ合衆国 (USA) 言語：英語 (EN)

SARS-CoV-2(SCV-2)伝達の制御は,SCV-2複製動力学の理解を必要とする主要な優先事項である。活性ウイルス複製時にのみ産生されるSCV-2サブゲノムRNA(sgRNA)を定量するための新規液滴デジタルPCR(ddPCR)アッセイを開発し,多重フォーマットで完全長ゲノムRNA(gRNA)からそれらを識別した。この多重ddPCRアッセイを144の横断的鼻咽頭試料に適用し,sgRNAsをqPCRサイクル閾値(Ct)値の範囲で定量し,Ct値と相関させた。sgRNA:gRNAの比率は広範囲のCt値にわたって顕著に安定であったが,ヒトハウスキーピング遺伝子に対するNsgRNAの調整された量はより高いCt値で低下した。興味深いことに,調節sgRNAとgRNA量は培養陰性試料で定量可能であったが,レベルは培養陽性試料より有意に低かった。14日までの6人の縦断日試験は,sgRNAが感染の最初の週の間,培養結果と一致することを明らかにしたが,感染後の培養とは不一致であった。さらに,sgRNA:gRNAはウイルス培養の変化にもかかわらず感染中に一定である。これらのデータは感染時の安定なウイルス転写を示す。ウイルスRNAの持続性にもかかわらず,培養が陰性であるかを理解するためには,より多くの研究が必要である。【JST・京大機械翻訳】

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ウイルスの生化学

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