細胞型組成分析:統計的方法の比較【JST・京大機械翻訳】

Simmons, S. K.

プレプリント

J-GLOBAL ID：202202221117803598 整理番号：22P0314404

細胞型組成分析:統計的方法の比較【JST・京大機械翻訳】

Cell Type Composition Analysis: Comparison of statistical methods

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発行年： 2022年02月08日プレプリントサーバーでの情報更新日： 2022年02月08日
JST資料番号： O7001B 資料種別：プレプリント
記事区分：プレプリント発行国：アメリカ合衆国 (USA) 言語：英語 (EN)

条件(疾患対非,ノックアウト対野生型,処理対非等)間の細胞型組成の変化を測定することは,単一細胞RNA-Seq分析における標準段階になる。それにも拘らず,この種の分析に対する最良のアプローチには一致がない。このように,著者らは,細胞タイプ組成分析のための多数の方法を試験し,それらが偽陽性率と電力に関してどのように実行されるかを見ることを決定した。1つの明確な勝者がないが,2つの方法(代替パラメータ化によるアシン正規化とDirichlet回帰によるプロペラ法)は,ほとんどの状況でよく機能した。最も重要なことに,異なる発現解析における結果と一致して,高い偽陽性率を回避するため,試料(マウスからマウス,人物など)の変動性を考慮に入れることが重要である。また,凝集(高擬似バルク)に基づく方法が,試験した混合モデル法をわずかに凌駕する証拠を見た。【JST・京大機械翻訳】

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, , , , , , 【Automatic Indexing@JST】

分子・遺伝情報処理 , 遺伝子発現 , 細胞生理一般

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