ハワイショウジョウバエにおける卵巣バイアス遺伝子発現の進化【JST・京大機械翻訳】

Church, S. H.; Munro, C.; Dunn, C.; Extavour, C. G.

プレプリント

J-GLOBAL ID：202202221128880195 整理番号：22P0028479

ハワイショウジョウバエにおける卵巣バイアス遺伝子発現の進化【JST・京大機械翻訳】

The evolution of ovary-biased gene expression in Hawaiian Drosophila

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発行年： 2022年07月02日プレプリントサーバーでの情報更新日： 2022年07月02日
JST資料番号： O7001B 資料種別：プレプリント
記事区分：プレプリント発行国：アメリカ合衆国 (USA) 言語：英語 (EN)

ますます幅広い種類の種からアクセス可能な遺伝子発現に関する1つの詳細なデータ,著者らは,モデル生物からの我々の発生遺伝学的知識が,種を通して発現パターンと変異を予測する程度を試験できる。しかし,種間の遺伝子発現における差異が有意であるかどうかを知るために,著者らは最初に,遺伝子発現における多くの進化的変動がどのように観察されるかを知る必要がある。ここでは,卵巣と他の組織の間の遺伝子発現差に焦点を当てて,ハワイのDrosophillidaeハエの12種にわたるRNAeqデータを解析することにより答えを提供した。進化時間にわたって,安定的で,実験室モデルDrosophila種から記述発現パターンに大部分対応する卵巣特異的遺伝子のコホートが存在することを示す。著者らの結果はまた,系統発生距離が増加するにつれて,種間の変動が組織型間の変動を圧倒するという予測の実証を提供した。発現の祖先状態再構成を用いて,組織バイアス発現における進化的変化の分布を記述し,これを用いて,これらの12種にわたる卵巣バイアス発現の獲得と損失を同定した。次に,この分布を用いて,遺伝子間の発現変化における進化的相関を計算し,D.melanogasterにおける既知の相互作用を有する遺伝子が,非または未知の相互作用を有する遺伝子よりも進化において有意に相関することを示した。最後に,進化軌跡を共有する遺伝子の新しいネットワークを推論するためにこの相関マトリックスを使用し,著者らはDrosophila卵巣の機能と進化における遺伝的役割と相互作用に関する新しい試験可能な仮説のデータセットとしてこれらの結果を提示する。【JST・京大機械翻訳】

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遺伝子発現 , 生殖器官

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