抄録/ポイント：
抄録/ポイント
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SARS-CoV-2のOmicron(BA.1/B.1.1.529)変異体は,そのスパイク蛋白質に37の突然変異を警告し,現在のCOVID-19ワクチンの有効性を低下させる。本研究では,SARS-CoV-2 S蛋白質変異体からCD8+およびCD4 ̄+T細胞エピトープを同定した。Omicron変異体から最も高い品質のCD8とCD4エピトープを同定するために,MHC IとMHC II分子の両方に対する高い結合親和性を有するエピトープを選択し,免疫原性,抗原性,アレルゲン性,不安定性,および毒性を含む他の臨床チェックポイント予測因子を適用した。その後,著者らは,それぞれ76.16%と97.46%の世界人口範囲を有する8つのOmicron(BA.1/B.1.1.529)特異的CD8+と11のCD4+T細胞エピトープを見つけた。さらに,SARS-CoV-2病原性に重要な変異を標的とするOmicron BA.1およびBA.2系統を横断した共通エピトープを同定した。さらに,B.1.1.529およびB.1.617.2(Delta)のような他の循環SARS-CoV-2変異体の共通エピトープを同定した。前臨床モデルにおけるワクチン候補を試験するために,マウスMHC対立遺伝子に対するCD8エピトープ結合親和性を予測した。CD8エピトープを,以前に開発したソフトウェアツールPCOptimを用いてさらに検証した。次に,ペプチド-MHCとペプチド-MHC-TCR複合体の間の結合相互作用を調べるために,著者らのトップCD8エピトープの三次元構造をモデル化した。重要なことに,同定したエピトープは,RNA結合ドメインとS蛋白質の融合部位での変異を標的化する。これは,ウイルス感染症を潜在的に除去し,むしろ短命のmRNAワクチンと比較して長期免疫応答を形成し,現在の流行および潜在的将来の変異体に対するワクチン候補の有効性を最大化する。【JST・京大機械翻訳】
